Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lnx1O70263 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lnx1O70263 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lnx1O70263 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lnx1O70263 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lnx1O70263 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lnx1O70263 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lnx1O70263 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lnx1O70263 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lnx1O70263 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lnx1O70263 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lnx1O70263 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lnx1O70263 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lnx1O70263 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lnx1O70263 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lnx1O70263 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lnx1O70263 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lnx1O70263 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lnx1O70263 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lnx1O70263 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lnx1O70263 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lnx1O70263 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lnx1O70263 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lnx1O70263 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lnx1O70263 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lnx1O70263 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lnx1O70263 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lnx1O70263 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lnx1O70263 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Lnx1O70263 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lnx1O70263 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lnx1O70263 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lnx1O70263 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lnx1O70263 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lnx1O70263 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lnx1O70263 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lnx1O70263 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lnx1O70263 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Lnx1O70263 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lnx1O70263 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Lnx1O70263 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lnx1O70263 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lnx1O70263 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lnx1O70263 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Lnx1O70263 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lnx1O70263 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lnx1O70263 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lnx1O70263 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lnx1O70263 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lnx1O70263 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lnx1O70263 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lnx1O70263 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lnx1O70263 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Lnx1O70263 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lnx1O70263 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lnx1O70263 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Lnx1O70263 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lnx1O70263 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lnx1O70263 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lnx1O70263 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lnx1O70263 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lnx1O70263 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lnx1O70263 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lnx1O70263 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lnx1O70263 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lnx1O70263 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Lnx1O70263 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lnx1O70263 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lnx1O70263 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lnx1O70263 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lnx1O70263 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lnx1O70263 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lnx1O70263 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lnx1O70263 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lnx1O70263 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lnx1O70263 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lnx1O70263 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lnx1O70263 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lnx1O70263 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lnx1O70263 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lnx1O70263 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lnx1O70263 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Lnx1O70263 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lnx1O70263 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lnx1O70263 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lnx1O70263 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lnx1O70263 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lnx1O70263 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lnx1O70263 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lnx1O70263 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lnx1O70263 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lnx1O70263 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lnx1O70263 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lnx1O70263 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lnx1O70263 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lnx1O70263 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lnx1O70263 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Lnx1O70263 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lnx1O70263 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lnx1O70263 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
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