Protein–RNA interactions for Protein: O55106

Strn, Striatin, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StrnO55106 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
StrnO55106 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
StrnO55106 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
StrnO55106 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
StrnO55106 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
StrnO55106 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
StrnO55106 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
StrnO55106 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
StrnO55106 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
StrnO55106 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
StrnO55106 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
StrnO55106 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
StrnO55106 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
StrnO55106 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
StrnO55106 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
StrnO55106 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
StrnO55106 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
StrnO55106 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
StrnO55106 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
StrnO55106 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
StrnO55106 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
StrnO55106 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
StrnO55106 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
StrnO55106 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
StrnO55106 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
StrnO55106 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
StrnO55106 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
StrnO55106 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
StrnO55106 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
StrnO55106 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
StrnO55106 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
StrnO55106 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
StrnO55106 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
StrnO55106 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
StrnO55106 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
StrnO55106 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
StrnO55106 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
StrnO55106 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
StrnO55106 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
StrnO55106 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
StrnO55106 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
StrnO55106 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
StrnO55106 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
StrnO55106 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
StrnO55106 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
StrnO55106 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
StrnO55106 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
StrnO55106 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
StrnO55106 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
StrnO55106 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
StrnO55106 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
StrnO55106 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
StrnO55106 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
StrnO55106 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
StrnO55106 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
StrnO55106 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
StrnO55106 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
StrnO55106 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
StrnO55106 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
StrnO55106 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
StrnO55106 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
StrnO55106 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
StrnO55106 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
StrnO55106 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
StrnO55106 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
StrnO55106 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
StrnO55106 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
StrnO55106 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
StrnO55106 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
StrnO55106 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
StrnO55106 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
StrnO55106 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
StrnO55106 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
StrnO55106 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
StrnO55106 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
StrnO55106 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
StrnO55106 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
StrnO55106 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
StrnO55106 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
StrnO55106 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
StrnO55106 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
StrnO55106 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
StrnO55106 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
StrnO55106 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
StrnO55106 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
StrnO55106 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
StrnO55106 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
StrnO55106 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
StrnO55106 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
StrnO55106 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
StrnO55106 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
StrnO55106 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
StrnO55106 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
StrnO55106 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
StrnO55106 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
StrnO55106 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
StrnO55106 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
StrnO55106 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
StrnO55106 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
StrnO55106 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms