Protein–RNA interactions for Protein: O54942

Cldn5, Claudin-5, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn5O54942 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Cldn5O54942 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cldn5O54942 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Cldn5O54942 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Cldn5O54942 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cldn5O54942 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cldn5O54942 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cldn5O54942 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cldn5O54942 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cldn5O54942 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cldn5O54942 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cldn5O54942 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cldn5O54942 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cldn5O54942 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cldn5O54942 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cldn5O54942 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cldn5O54942 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cldn5O54942 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cldn5O54942 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cldn5O54942 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cldn5O54942 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cldn5O54942 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cldn5O54942 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cldn5O54942 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cldn5O54942 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cldn5O54942 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cldn5O54942 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cldn5O54942 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cldn5O54942 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Cldn5O54942 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cldn5O54942 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cldn5O54942 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cldn5O54942 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cldn5O54942 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn5O54942 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn5O54942 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn5O54942 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn5O54942 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn5O54942 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn5O54942 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn5O54942 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn5O54942 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn5O54942 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn5O54942 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn5O54942 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Cldn5O54942 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cldn5O54942 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cldn5O54942 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cldn5O54942 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cldn5O54942 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cldn5O54942 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cldn5O54942 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cldn5O54942 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cldn5O54942 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cldn5O54942 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cldn5O54942 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn5O54942 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn5O54942 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn5O54942 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn5O54942 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn5O54942 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn5O54942 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn5O54942 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn5O54942 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn5O54942 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn5O54942 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn5O54942 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn5O54942 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn5O54942 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn5O54942 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn5O54942 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn5O54942 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn5O54942 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn5O54942 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn5O54942 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn5O54942 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn5O54942 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn5O54942 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn5O54942 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cldn5O54942 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cldn5O54942 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cldn5O54942 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cldn5O54942 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cldn5O54942 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Cldn5O54942 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Cldn5O54942 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cldn5O54942 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cldn5O54942 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cldn5O54942 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cldn5O54942 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn5O54942 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn5O54942 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn5O54942 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn5O54942 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn5O54942 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cldn5O54942 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cldn5O54942 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cldn5O54942 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cldn5O54942 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cldn5O54942 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
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