Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TsksO54887 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TsksO54887 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TsksO54887 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TsksO54887 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TsksO54887 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TsksO54887 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TsksO54887 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TsksO54887 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TsksO54887 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TsksO54887 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TsksO54887 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TsksO54887 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TsksO54887 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TsksO54887 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TsksO54887 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TsksO54887 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TsksO54887 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TsksO54887 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TsksO54887 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TsksO54887 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TsksO54887 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TsksO54887 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TsksO54887 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TsksO54887 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TsksO54887 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TsksO54887 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TsksO54887 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TsksO54887 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TsksO54887 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TsksO54887 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TsksO54887 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TsksO54887 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TsksO54887 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TsksO54887 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TsksO54887 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TsksO54887 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TsksO54887 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TsksO54887 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TsksO54887 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TsksO54887 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TsksO54887 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TsksO54887 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TsksO54887 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TsksO54887 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TsksO54887 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TsksO54887 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TsksO54887 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TsksO54887 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TsksO54887 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TsksO54887 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TsksO54887 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TsksO54887 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TsksO54887 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TsksO54887 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TsksO54887 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TsksO54887 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TsksO54887 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TsksO54887 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TsksO54887 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TsksO54887 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TsksO54887 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TsksO54887 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TsksO54887 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TsksO54887 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TsksO54887 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TsksO54887 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TsksO54887 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TsksO54887 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TsksO54887 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TsksO54887 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25■■□□□ 1.59
TsksO54887 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TsksO54887 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TsksO54887 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TsksO54887 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TsksO54887 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TsksO54887 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TsksO54887 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TsksO54887 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TsksO54887 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TsksO54887 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TsksO54887 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TsksO54887 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TsksO54887 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TsksO54887 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TsksO54887 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TsksO54887 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TsksO54887 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TsksO54887 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TsksO54887 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TsksO54887 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TsksO54887 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TsksO54887 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TsksO54887 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TsksO54887 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TsksO54887 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TsksO54887 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TsksO54887 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TsksO54887 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TsksO54887 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 2232.2 ms