Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

Predictions only

Length 4,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TnxbO35452 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TnxbO35452 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TnxbO35452 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TnxbO35452 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TnxbO35452 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TnxbO35452 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TnxbO35452 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TnxbO35452 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TnxbO35452 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TnxbO35452 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TnxbO35452 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TnxbO35452 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TnxbO35452 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TnxbO35452 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TnxbO35452 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TnxbO35452 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TnxbO35452 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TnxbO35452 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TnxbO35452 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TnxbO35452 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TnxbO35452 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TnxbO35452 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TnxbO35452 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TnxbO35452 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TnxbO35452 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TnxbO35452 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TnxbO35452 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TnxbO35452 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TnxbO35452 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TnxbO35452 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TnxbO35452 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TnxbO35452 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TnxbO35452 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TnxbO35452 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TnxbO35452 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TnxbO35452 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TnxbO35452 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TnxbO35452 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TnxbO35452 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TnxbO35452 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TnxbO35452 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TnxbO35452 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TnxbO35452 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TnxbO35452 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TnxbO35452 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TnxbO35452 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TnxbO35452 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TnxbO35452 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TnxbO35452 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TnxbO35452 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TnxbO35452 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TnxbO35452 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TnxbO35452 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TnxbO35452 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TnxbO35452 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TnxbO35452 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TnxbO35452 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TnxbO35452 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TnxbO35452 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TnxbO35452 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TnxbO35452 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TnxbO35452 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TnxbO35452 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TnxbO35452 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TnxbO35452 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TnxbO35452 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TnxbO35452 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TnxbO35452 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TnxbO35452 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TnxbO35452 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TnxbO35452 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TnxbO35452 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TnxbO35452 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TnxbO35452 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TnxbO35452 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TnxbO35452 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TnxbO35452 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TnxbO35452 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TnxbO35452 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TnxbO35452 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TnxbO35452 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TnxbO35452 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TnxbO35452 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TnxbO35452 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TnxbO35452 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TnxbO35452 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TnxbO35452 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TnxbO35452 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TnxbO35452 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TnxbO35452 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TnxbO35452 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TnxbO35452 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TnxbO35452 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TnxbO35452 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TnxbO35452 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TnxbO35452 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TnxbO35452 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TnxbO35452 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TnxbO35452 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138.6 ms