Protein–RNA interactions for Protein: O35393

Efnb3, Ephrin-B3, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb3O35393 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efnb3O35393 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efnb3O35393 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efnb3O35393 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efnb3O35393 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Efnb3O35393 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efnb3O35393 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efnb3O35393 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efnb3O35393 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efnb3O35393 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efnb3O35393 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efnb3O35393 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efnb3O35393 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efnb3O35393 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efnb3O35393 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efnb3O35393 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efnb3O35393 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efnb3O35393 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efnb3O35393 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efnb3O35393 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efnb3O35393 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efnb3O35393 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Efnb3O35393 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efnb3O35393 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efnb3O35393 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efnb3O35393 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efnb3O35393 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efnb3O35393 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efnb3O35393 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efnb3O35393 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efnb3O35393 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efnb3O35393 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efnb3O35393 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Efnb3O35393 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Efnb3O35393 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Efnb3O35393 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Efnb3O35393 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Efnb3O35393 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Efnb3O35393 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Efnb3O35393 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Efnb3O35393 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Efnb3O35393 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Efnb3O35393 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Efnb3O35393 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Efnb3O35393 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Efnb3O35393 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Efnb3O35393 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Efnb3O35393 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Efnb3O35393 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Efnb3O35393 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Efnb3O35393 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Efnb3O35393 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Efnb3O35393 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Efnb3O35393 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Efnb3O35393 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Efnb3O35393 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Efnb3O35393 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Efnb3O35393 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Efnb3O35393 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Efnb3O35393 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Efnb3O35393 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Efnb3O35393 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Efnb3O35393 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Efnb3O35393 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Efnb3O35393 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Efnb3O35393 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Efnb3O35393 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Efnb3O35393 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Efnb3O35393 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Efnb3O35393 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Efnb3O35393 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Efnb3O35393 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Efnb3O35393 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Efnb3O35393 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Efnb3O35393 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Efnb3O35393 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Efnb3O35393 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Efnb3O35393 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Efnb3O35393 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Efnb3O35393 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Efnb3O35393 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Efnb3O35393 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Efnb3O35393 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Efnb3O35393 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Efnb3O35393 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Efnb3O35393 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Efnb3O35393 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Efnb3O35393 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Efnb3O35393 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Efnb3O35393 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Efnb3O35393 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Efnb3O35393 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Efnb3O35393 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Efnb3O35393 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Efnb3O35393 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Efnb3O35393 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Efnb3O35393 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Efnb3O35393 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Efnb3O35393 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Efnb3O35393 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms