Protein–RNA interactions for Protein: O35345

Kpna6, Importin subunit alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna6O35345 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kpna6O35345 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kpna6O35345 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kpna6O35345 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kpna6O35345 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kpna6O35345 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kpna6O35345 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kpna6O35345 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kpna6O35345 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kpna6O35345 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kpna6O35345 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kpna6O35345 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kpna6O35345 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kpna6O35345 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kpna6O35345 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kpna6O35345 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kpna6O35345 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kpna6O35345 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Kpna6O35345 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kpna6O35345 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kpna6O35345 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kpna6O35345 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kpna6O35345 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kpna6O35345 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kpna6O35345 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kpna6O35345 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Kpna6O35345 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kpna6O35345 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kpna6O35345 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kpna6O35345 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kpna6O35345 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kpna6O35345 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kpna6O35345 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kpna6O35345 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kpna6O35345 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kpna6O35345 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kpna6O35345 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kpna6O35345 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kpna6O35345 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kpna6O35345 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Kpna6O35345 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kpna6O35345 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kpna6O35345 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kpna6O35345 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kpna6O35345 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kpna6O35345 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kpna6O35345 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kpna6O35345 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kpna6O35345 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kpna6O35345 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kpna6O35345 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kpna6O35345 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kpna6O35345 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kpna6O35345 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kpna6O35345 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kpna6O35345 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kpna6O35345 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kpna6O35345 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kpna6O35345 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kpna6O35345 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kpna6O35345 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kpna6O35345 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kpna6O35345 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kpna6O35345 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kpna6O35345 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kpna6O35345 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kpna6O35345 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kpna6O35345 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kpna6O35345 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kpna6O35345 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kpna6O35345 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Kpna6O35345 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Kpna6O35345 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Kpna6O35345 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kpna6O35345 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kpna6O35345 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Kpna6O35345 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Kpna6O35345 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kpna6O35345 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kpna6O35345 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kpna6O35345 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kpna6O35345 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kpna6O35345 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kpna6O35345 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kpna6O35345 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kpna6O35345 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kpna6O35345 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kpna6O35345 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Kpna6O35345 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kpna6O35345 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kpna6O35345 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kpna6O35345 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Kpna6O35345 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Kpna6O35345 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kpna6O35345 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kpna6O35345 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Kpna6O35345 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kpna6O35345 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kpna6O35345 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Kpna6O35345 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.2 ms