Protein–RNA interactions for Protein: O08686

Barx2, Homeobox protein BarH-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx2O08686 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Barx2O08686 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Barx2O08686 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Barx2O08686 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Barx2O08686 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Barx2O08686 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Barx2O08686 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Barx2O08686 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Barx2O08686 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Barx2O08686 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Barx2O08686 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Barx2O08686 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Barx2O08686 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Barx2O08686 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Barx2O08686 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Barx2O08686 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Barx2O08686 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Barx2O08686 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Barx2O08686 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Barx2O08686 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Barx2O08686 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Barx2O08686 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Barx2O08686 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Barx2O08686 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Barx2O08686 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Barx2O08686 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Barx2O08686 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Barx2O08686 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Barx2O08686 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Barx2O08686 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Barx2O08686 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Barx2O08686 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Barx2O08686 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Barx2O08686 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Barx2O08686 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Barx2O08686 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Barx2O08686 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Barx2O08686 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Barx2O08686 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Barx2O08686 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Barx2O08686 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Barx2O08686 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Barx2O08686 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Barx2O08686 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Barx2O08686 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Barx2O08686 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Barx2O08686 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Barx2O08686 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Barx2O08686 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Barx2O08686 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Barx2O08686 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Barx2O08686 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Barx2O08686 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Barx2O08686 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Barx2O08686 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Barx2O08686 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Barx2O08686 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Barx2O08686 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Barx2O08686 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Barx2O08686 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Barx2O08686 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Barx2O08686 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Barx2O08686 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Barx2O08686 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Barx2O08686 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Barx2O08686 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Barx2O08686 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Barx2O08686 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Barx2O08686 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Barx2O08686 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Barx2O08686 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Barx2O08686 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Barx2O08686 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Barx2O08686 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Barx2O08686 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Barx2O08686 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Barx2O08686 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Barx2O08686 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Barx2O08686 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Barx2O08686 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Barx2O08686 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Barx2O08686 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Barx2O08686 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Barx2O08686 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Barx2O08686 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Barx2O08686 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Barx2O08686 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Barx2O08686 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Barx2O08686 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Barx2O08686 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Barx2O08686 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Barx2O08686 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Barx2O08686 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Barx2O08686 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Barx2O08686 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Barx2O08686 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Barx2O08686 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Barx2O08686 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Barx2O08686 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Barx2O08686 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms