Protein–RNA interactions for Protein: M0QW51

Gm17078, Predicted gene 17078, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17078M0QW51 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm17078M0QW51 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm17078M0QW51 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm17078M0QW51 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm17078M0QW51 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm17078M0QW51 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm17078M0QW51 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm17078M0QW51 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm17078M0QW51 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm17078M0QW51 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm17078M0QW51 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm17078M0QW51 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm17078M0QW51 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm17078M0QW51 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm17078M0QW51 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm17078M0QW51 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm17078M0QW51 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm17078M0QW51 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm17078M0QW51 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm17078M0QW51 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm17078M0QW51 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm17078M0QW51 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm17078M0QW51 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm17078M0QW51 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm17078M0QW51 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm17078M0QW51 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm17078M0QW51 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm17078M0QW51 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm17078M0QW51 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm17078M0QW51 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm17078M0QW51 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm17078M0QW51 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm17078M0QW51 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm17078M0QW51 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm17078M0QW51 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm17078M0QW51 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm17078M0QW51 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm17078M0QW51 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm17078M0QW51 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm17078M0QW51 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm17078M0QW51 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm17078M0QW51 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm17078M0QW51 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm17078M0QW51 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm17078M0QW51 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm17078M0QW51 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm17078M0QW51 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm17078M0QW51 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm17078M0QW51 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm17078M0QW51 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm17078M0QW51 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm17078M0QW51 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm17078M0QW51 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm17078M0QW51 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm17078M0QW51 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm17078M0QW51 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm17078M0QW51 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm17078M0QW51 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm17078M0QW51 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm17078M0QW51 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm17078M0QW51 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm17078M0QW51 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm17078M0QW51 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm17078M0QW51 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm17078M0QW51 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm17078M0QW51 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm17078M0QW51 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm17078M0QW51 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm17078M0QW51 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm17078M0QW51 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm17078M0QW51 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm17078M0QW51 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm17078M0QW51 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm17078M0QW51 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm17078M0QW51 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm17078M0QW51 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm17078M0QW51 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm17078M0QW51 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm17078M0QW51 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm17078M0QW51 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm17078M0QW51 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm17078M0QW51 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm17078M0QW51 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm17078M0QW51 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm17078M0QW51 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm17078M0QW51 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm17078M0QW51 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm17078M0QW51 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm17078M0QW51 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm17078M0QW51 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm17078M0QW51 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm17078M0QW51 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm17078M0QW51 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm17078M0QW51 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm17078M0QW51 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm17078M0QW51 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm17078M0QW51 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm17078M0QW51 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm17078M0QW51 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm17078M0QW51 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms