Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ59

Gm3383, Predicted gene 3194, mousemouse

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3383J3QQ59 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm3383J3QQ59 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm3383J3QQ59 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm3383J3QQ59 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm3383J3QQ59 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm3383J3QQ59 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm3383J3QQ59 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm3383J3QQ59 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm3383J3QQ59 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm3383J3QQ59 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm3383J3QQ59 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm3383J3QQ59 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm3383J3QQ59 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm3383J3QQ59 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm3383J3QQ59 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm3383J3QQ59 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm3383J3QQ59 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm3383J3QQ59 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm3383J3QQ59 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm3383J3QQ59 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm3383J3QQ59 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm3383J3QQ59 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm3383J3QQ59 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm3383J3QQ59 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm3383J3QQ59 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm3383J3QQ59 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm3383J3QQ59 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm3383J3QQ59 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm3383J3QQ59 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm3383J3QQ59 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm3383J3QQ59 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm3383J3QQ59 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm3383J3QQ59 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm3383J3QQ59 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm3383J3QQ59 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm3383J3QQ59 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm3383J3QQ59 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm3383J3QQ59 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm3383J3QQ59 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm3383J3QQ59 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm3383J3QQ59 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm3383J3QQ59 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm3383J3QQ59 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm3383J3QQ59 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm3383J3QQ59 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm3383J3QQ59 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm3383J3QQ59 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm3383J3QQ59 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm3383J3QQ59 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm3383J3QQ59 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm3383J3QQ59 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm3383J3QQ59 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm3383J3QQ59 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm3383J3QQ59 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm3383J3QQ59 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm3383J3QQ59 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm3383J3QQ59 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm3383J3QQ59 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm3383J3QQ59 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm3383J3QQ59 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm3383J3QQ59 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm3383J3QQ59 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm3383J3QQ59 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm3383J3QQ59 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm3383J3QQ59 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm3383J3QQ59 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm3383J3QQ59 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm3383J3QQ59 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm3383J3QQ59 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm3383J3QQ59 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm3383J3QQ59 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm3383J3QQ59 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm3383J3QQ59 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm3383J3QQ59 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm3383J3QQ59 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm3383J3QQ59 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm3383J3QQ59 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm3383J3QQ59 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3383J3QQ59 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3383J3QQ59 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3383J3QQ59 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3383J3QQ59 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3383J3QQ59 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm3383J3QQ59 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm3383J3QQ59 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm3383J3QQ59 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm3383J3QQ59 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm3383J3QQ59 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm3383J3QQ59 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm3383J3QQ59 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm3383J3QQ59 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm3383J3QQ59 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm3383J3QQ59 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm3383J3QQ59 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm3383J3QQ59 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm3383J3QQ59 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm3383J3QQ59 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm3383J3QQ59 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm3383J3QQ59 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm3383J3QQ59 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms