Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
4930544D05RikJ3QK56 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
4930544D05RikJ3QK56 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
4930544D05RikJ3QK56 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
4930544D05RikJ3QK56 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
4930544D05RikJ3QK56 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
4930544D05RikJ3QK56 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
4930544D05RikJ3QK56 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4930544D05RikJ3QK56 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4930544D05RikJ3QK56 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4930544D05RikJ3QK56 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4930544D05RikJ3QK56 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
4930544D05RikJ3QK56 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4930544D05RikJ3QK56 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4930544D05RikJ3QK56 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4930544D05RikJ3QK56 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4930544D05RikJ3QK56 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4930544D05RikJ3QK56 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4930544D05RikJ3QK56 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4930544D05RikJ3QK56 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
4930544D05RikJ3QK56 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
4930544D05RikJ3QK56 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
4930544D05RikJ3QK56 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
4930544D05RikJ3QK56 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
4930544D05RikJ3QK56 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
4930544D05RikJ3QK56 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
4930544D05RikJ3QK56 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
4930544D05RikJ3QK56 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
4930544D05RikJ3QK56 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
4930544D05RikJ3QK56 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
4930544D05RikJ3QK56 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
4930544D05RikJ3QK56 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
4930544D05RikJ3QK56 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
4930544D05RikJ3QK56 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
4930544D05RikJ3QK56 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
4930544D05RikJ3QK56 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
4930544D05RikJ3QK56 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
4930544D05RikJ3QK56 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
4930544D05RikJ3QK56 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
4930544D05RikJ3QK56 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
4930544D05RikJ3QK56 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4930544D05RikJ3QK56 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4930544D05RikJ3QK56 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4930544D05RikJ3QK56 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4930544D05RikJ3QK56 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4930544D05RikJ3QK56 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4930544D05RikJ3QK56 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
4930544D05RikJ3QK56 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
4930544D05RikJ3QK56 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4930544D05RikJ3QK56 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
4930544D05RikJ3QK56 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4930544D05RikJ3QK56 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4930544D05RikJ3QK56 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4930544D05RikJ3QK56 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4930544D05RikJ3QK56 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
4930544D05RikJ3QK56 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4930544D05RikJ3QK56 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4930544D05RikJ3QK56 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
4930544D05RikJ3QK56 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4930544D05RikJ3QK56 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4930544D05RikJ3QK56 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4930544D05RikJ3QK56 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
4930544D05RikJ3QK56 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
4930544D05RikJ3QK56 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
4930544D05RikJ3QK56 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4930544D05RikJ3QK56 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4930544D05RikJ3QK56 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4930544D05RikJ3QK56 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
4930544D05RikJ3QK56 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4930544D05RikJ3QK56 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4930544D05RikJ3QK56 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
4930544D05RikJ3QK56 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4930544D05RikJ3QK56 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4930544D05RikJ3QK56 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
4930544D05RikJ3QK56 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4930544D05RikJ3QK56 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4930544D05RikJ3QK56 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
4930544D05RikJ3QK56 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
4930544D05RikJ3QK56 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
4930544D05RikJ3QK56 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
4930544D05RikJ3QK56 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
4930544D05RikJ3QK56 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
4930544D05RikJ3QK56 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4930544D05RikJ3QK56 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
4930544D05RikJ3QK56 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4930544D05RikJ3QK56 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4930544D05RikJ3QK56 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4930544D05RikJ3QK56 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4930544D05RikJ3QK56 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4930544D05RikJ3QK56 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4930544D05RikJ3QK56 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930544D05RikJ3QK56 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930544D05RikJ3QK56 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930544D05RikJ3QK56 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930544D05RikJ3QK56 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930544D05RikJ3QK56 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930544D05RikJ3QK56 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930544D05RikJ3QK56 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
4930544D05RikJ3QK56 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4930544D05RikJ3QK56 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms