Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS0

Gm21411, Predicted gene, 21411, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21411J3KMS0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm21411J3KMS0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm21411J3KMS0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm21411J3KMS0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm21411J3KMS0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm21411J3KMS0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm21411J3KMS0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm21411J3KMS0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm21411J3KMS0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm21411J3KMS0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm21411J3KMS0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm21411J3KMS0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm21411J3KMS0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm21411J3KMS0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm21411J3KMS0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm21411J3KMS0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm21411J3KMS0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm21411J3KMS0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm21411J3KMS0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm21411J3KMS0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm21411J3KMS0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm21411J3KMS0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm21411J3KMS0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm21411J3KMS0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm21411J3KMS0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm21411J3KMS0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gm21411J3KMS0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gm21411J3KMS0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gm21411J3KMS0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm21411J3KMS0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm21411J3KMS0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm21411J3KMS0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm21411J3KMS0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm21411J3KMS0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm21411J3KMS0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm21411J3KMS0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm21411J3KMS0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm21411J3KMS0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm21411J3KMS0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm21411J3KMS0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm21411J3KMS0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm21411J3KMS0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm21411J3KMS0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm21411J3KMS0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm21411J3KMS0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm21411J3KMS0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm21411J3KMS0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm21411J3KMS0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm21411J3KMS0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm21411J3KMS0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm21411J3KMS0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm21411J3KMS0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm21411J3KMS0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm21411J3KMS0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm21411J3KMS0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm21411J3KMS0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm21411J3KMS0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm21411J3KMS0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm21411J3KMS0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm21411J3KMS0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm21411J3KMS0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm21411J3KMS0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm21411J3KMS0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm21411J3KMS0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm21411J3KMS0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm21411J3KMS0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm21411J3KMS0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm21411J3KMS0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm21411J3KMS0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm21411J3KMS0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm21411J3KMS0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm21411J3KMS0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm21411J3KMS0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm21411J3KMS0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm21411J3KMS0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm21411J3KMS0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm21411J3KMS0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm21411J3KMS0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm21411J3KMS0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm21411J3KMS0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm21411J3KMS0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm21411J3KMS0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm21411J3KMS0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm21411J3KMS0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm21411J3KMS0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm21411J3KMS0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm21411J3KMS0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm21411J3KMS0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm21411J3KMS0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm21411J3KMS0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm21411J3KMS0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm21411J3KMS0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm21411J3KMS0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm21411J3KMS0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm21411J3KMS0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm21411J3KMS0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm21411J3KMS0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm21411J3KMS0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm21411J3KMS0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm21411J3KMS0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
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