Protein–RNA interactions for Protein: G3X9M3

Hmgxb3, HMG box domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgxb3G3X9M3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hmgxb3G3X9M3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hmgxb3G3X9M3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hmgxb3G3X9M3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hmgxb3G3X9M3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hmgxb3G3X9M3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hmgxb3G3X9M3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hmgxb3G3X9M3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hmgxb3G3X9M3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hmgxb3G3X9M3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hmgxb3G3X9M3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hmgxb3G3X9M3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hmgxb3G3X9M3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hmgxb3G3X9M3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hmgxb3G3X9M3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hmgxb3G3X9M3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hmgxb3G3X9M3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hmgxb3G3X9M3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hmgxb3G3X9M3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hmgxb3G3X9M3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hmgxb3G3X9M3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hmgxb3G3X9M3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hmgxb3G3X9M3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Hmgxb3G3X9M3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hmgxb3G3X9M3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hmgxb3G3X9M3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hmgxb3G3X9M3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hmgxb3G3X9M3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hmgxb3G3X9M3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hmgxb3G3X9M3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hmgxb3G3X9M3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hmgxb3G3X9M3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hmgxb3G3X9M3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hmgxb3G3X9M3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hmgxb3G3X9M3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hmgxb3G3X9M3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hmgxb3G3X9M3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hmgxb3G3X9M3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hmgxb3G3X9M3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hmgxb3G3X9M3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hmgxb3G3X9M3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hmgxb3G3X9M3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hmgxb3G3X9M3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hmgxb3G3X9M3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hmgxb3G3X9M3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hmgxb3G3X9M3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hmgxb3G3X9M3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hmgxb3G3X9M3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Hmgxb3G3X9M3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hmgxb3G3X9M3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hmgxb3G3X9M3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hmgxb3G3X9M3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hmgxb3G3X9M3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hmgxb3G3X9M3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hmgxb3G3X9M3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hmgxb3G3X9M3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hmgxb3G3X9M3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hmgxb3G3X9M3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hmgxb3G3X9M3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hmgxb3G3X9M3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Hmgxb3G3X9M3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hmgxb3G3X9M3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hmgxb3G3X9M3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hmgxb3G3X9M3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hmgxb3G3X9M3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hmgxb3G3X9M3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hmgxb3G3X9M3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hmgxb3G3X9M3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hmgxb3G3X9M3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hmgxb3G3X9M3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hmgxb3G3X9M3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hmgxb3G3X9M3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Hmgxb3G3X9M3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hmgxb3G3X9M3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hmgxb3G3X9M3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hmgxb3G3X9M3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hmgxb3G3X9M3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Hmgxb3G3X9M3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hmgxb3G3X9M3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hmgxb3G3X9M3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hmgxb3G3X9M3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hmgxb3G3X9M3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hmgxb3G3X9M3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hmgxb3G3X9M3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hmgxb3G3X9M3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hmgxb3G3X9M3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hmgxb3G3X9M3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hmgxb3G3X9M3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hmgxb3G3X9M3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Hmgxb3G3X9M3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hmgxb3G3X9M3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hmgxb3G3X9M3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hmgxb3G3X9M3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hmgxb3G3X9M3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hmgxb3G3X9M3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hmgxb3G3X9M3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hmgxb3G3X9M3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hmgxb3G3X9M3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hmgxb3G3X9M3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hmgxb3G3X9M3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms