Protein–RNA interactions for Protein: F8VPK8

Pcdh9, Protocadherin 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh9F8VPK8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Pcdh9F8VPK8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pcdh9F8VPK8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pcdh9F8VPK8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pcdh9F8VPK8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Pcdh9F8VPK8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Pcdh9F8VPK8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pcdh9F8VPK8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pcdh9F8VPK8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Pcdh9F8VPK8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pcdh9F8VPK8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pcdh9F8VPK8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pcdh9F8VPK8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pcdh9F8VPK8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pcdh9F8VPK8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pcdh9F8VPK8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pcdh9F8VPK8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pcdh9F8VPK8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pcdh9F8VPK8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Pcdh9F8VPK8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pcdh9F8VPK8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pcdh9F8VPK8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pcdh9F8VPK8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pcdh9F8VPK8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pcdh9F8VPK8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pcdh9F8VPK8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pcdh9F8VPK8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Pcdh9F8VPK8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pcdh9F8VPK8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pcdh9F8VPK8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pcdh9F8VPK8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pcdh9F8VPK8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pcdh9F8VPK8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pcdh9F8VPK8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Pcdh9F8VPK8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pcdh9F8VPK8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pcdh9F8VPK8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pcdh9F8VPK8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pcdh9F8VPK8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pcdh9F8VPK8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pcdh9F8VPK8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pcdh9F8VPK8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pcdh9F8VPK8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Pcdh9F8VPK8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pcdh9F8VPK8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pcdh9F8VPK8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pcdh9F8VPK8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pcdh9F8VPK8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pcdh9F8VPK8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pcdh9F8VPK8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pcdh9F8VPK8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pcdh9F8VPK8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pcdh9F8VPK8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pcdh9F8VPK8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pcdh9F8VPK8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pcdh9F8VPK8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pcdh9F8VPK8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pcdh9F8VPK8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pcdh9F8VPK8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pcdh9F8VPK8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pcdh9F8VPK8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pcdh9F8VPK8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pcdh9F8VPK8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pcdh9F8VPK8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Pcdh9F8VPK8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pcdh9F8VPK8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pcdh9F8VPK8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pcdh9F8VPK8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pcdh9F8VPK8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pcdh9F8VPK8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Pcdh9F8VPK8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pcdh9F8VPK8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pcdh9F8VPK8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pcdh9F8VPK8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pcdh9F8VPK8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pcdh9F8VPK8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pcdh9F8VPK8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pcdh9F8VPK8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pcdh9F8VPK8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pcdh9F8VPK8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pcdh9F8VPK8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pcdh9F8VPK8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pcdh9F8VPK8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pcdh9F8VPK8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pcdh9F8VPK8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pcdh9F8VPK8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pcdh9F8VPK8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pcdh9F8VPK8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pcdh9F8VPK8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pcdh9F8VPK8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pcdh9F8VPK8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pcdh9F8VPK8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pcdh9F8VPK8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pcdh9F8VPK8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pcdh9F8VPK8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pcdh9F8VPK8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pcdh9F8VPK8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pcdh9F8VPK8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pcdh9F8VPK8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pcdh9F8VPK8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms