Protein–RNA interactions for Protein: F7CCV5

Gm3443, Predicted gene 3443, mousemouse

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Length 94 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3443F7CCV5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3443F7CCV5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3443F7CCV5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3443F7CCV5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3443F7CCV5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3443F7CCV5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3443F7CCV5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3443F7CCV5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3443F7CCV5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3443F7CCV5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3443F7CCV5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3443F7CCV5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3443F7CCV5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3443F7CCV5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3443F7CCV5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3443F7CCV5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3443F7CCV5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3443F7CCV5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3443F7CCV5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3443F7CCV5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3443F7CCV5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3443F7CCV5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3443F7CCV5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3443F7CCV5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3443F7CCV5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3443F7CCV5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3443F7CCV5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3443F7CCV5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3443F7CCV5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3443F7CCV5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3443F7CCV5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3443F7CCV5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3443F7CCV5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3443F7CCV5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3443F7CCV5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3443F7CCV5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm3443F7CCV5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm3443F7CCV5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3443F7CCV5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3443F7CCV5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3443F7CCV5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3443F7CCV5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3443F7CCV5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3443F7CCV5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3443F7CCV5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3443F7CCV5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3443F7CCV5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3443F7CCV5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3443F7CCV5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3443F7CCV5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3443F7CCV5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3443F7CCV5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3443F7CCV5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3443F7CCV5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3443F7CCV5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3443F7CCV5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3443F7CCV5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3443F7CCV5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3443F7CCV5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3443F7CCV5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3443F7CCV5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3443F7CCV5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3443F7CCV5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3443F7CCV5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3443F7CCV5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3443F7CCV5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3443F7CCV5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3443F7CCV5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3443F7CCV5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3443F7CCV5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3443F7CCV5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3443F7CCV5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3443F7CCV5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3443F7CCV5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3443F7CCV5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3443F7CCV5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3443F7CCV5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3443F7CCV5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3443F7CCV5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3443F7CCV5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3443F7CCV5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3443F7CCV5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3443F7CCV5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3443F7CCV5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3443F7CCV5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3443F7CCV5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3443F7CCV5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3443F7CCV5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3443F7CCV5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3443F7CCV5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3443F7CCV5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3443F7CCV5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3443F7CCV5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3443F7CCV5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3443F7CCV5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3443F7CCV5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3443F7CCV5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3443F7CCV5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3443F7CCV5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3443F7CCV5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms