Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm28048F7BCN0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm28048F7BCN0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm28048F7BCN0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm28048F7BCN0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm28048F7BCN0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm28048F7BCN0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm28048F7BCN0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm28048F7BCN0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm28048F7BCN0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm28048F7BCN0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm28048F7BCN0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm28048F7BCN0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm28048F7BCN0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm28048F7BCN0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm28048F7BCN0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm28048F7BCN0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm28048F7BCN0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm28048F7BCN0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm28048F7BCN0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm28048F7BCN0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm28048F7BCN0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm28048F7BCN0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm28048F7BCN0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm28048F7BCN0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm28048F7BCN0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm28048F7BCN0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm28048F7BCN0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm28048F7BCN0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm28048F7BCN0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm28048F7BCN0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm28048F7BCN0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm28048F7BCN0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm28048F7BCN0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm28048F7BCN0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gm28048F7BCN0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gm28048F7BCN0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm28048F7BCN0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm28048F7BCN0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm28048F7BCN0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm28048F7BCN0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm28048F7BCN0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm28048F7BCN0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm28048F7BCN0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm28048F7BCN0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm28048F7BCN0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm28048F7BCN0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm28048F7BCN0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm28048F7BCN0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm28048F7BCN0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm28048F7BCN0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm28048F7BCN0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm28048F7BCN0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm28048F7BCN0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm28048F7BCN0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm28048F7BCN0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm28048F7BCN0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm28048F7BCN0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm28048F7BCN0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm28048F7BCN0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm28048F7BCN0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm28048F7BCN0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm28048F7BCN0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm28048F7BCN0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm28048F7BCN0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm28048F7BCN0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm28048F7BCN0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm28048F7BCN0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm28048F7BCN0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm28048F7BCN0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm28048F7BCN0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm28048F7BCN0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm28048F7BCN0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm28048F7BCN0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm28048F7BCN0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm28048F7BCN0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm28048F7BCN0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm28048F7BCN0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm28048F7BCN0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm28048F7BCN0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm28048F7BCN0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm28048F7BCN0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm28048F7BCN0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm28048F7BCN0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm28048F7BCN0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm28048F7BCN0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm28048F7BCN0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm28048F7BCN0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm28048F7BCN0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm28048F7BCN0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm28048F7BCN0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm28048F7BCN0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm28048F7BCN0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm28048F7BCN0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm28048F7BCN0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm28048F7BCN0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm28048F7BCN0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm28048F7BCN0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm28048F7BCN0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm28048F7BCN0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms