Protein–RNA interactions for Protein: F6YH22

Gm5218, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5218F6YH22 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5218F6YH22 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5218F6YH22 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5218F6YH22 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5218F6YH22 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5218F6YH22 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5218F6YH22 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5218F6YH22 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5218F6YH22 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5218F6YH22 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5218F6YH22 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5218F6YH22 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5218F6YH22 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5218F6YH22 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5218F6YH22 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5218F6YH22 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5218F6YH22 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5218F6YH22 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5218F6YH22 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5218F6YH22 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5218F6YH22 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5218F6YH22 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5218F6YH22 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5218F6YH22 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5218F6YH22 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5218F6YH22 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5218F6YH22 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5218F6YH22 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5218F6YH22 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5218F6YH22 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5218F6YH22 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5218F6YH22 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5218F6YH22 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5218F6YH22 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5218F6YH22 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gm5218F6YH22 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5218F6YH22 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5218F6YH22 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5218F6YH22 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5218F6YH22 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5218F6YH22 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5218F6YH22 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5218F6YH22 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5218F6YH22 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5218F6YH22 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5218F6YH22 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5218F6YH22 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5218F6YH22 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5218F6YH22 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5218F6YH22 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5218F6YH22 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5218F6YH22 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5218F6YH22 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5218F6YH22 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5218F6YH22 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5218F6YH22 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5218F6YH22 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5218F6YH22 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5218F6YH22 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5218F6YH22 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5218F6YH22 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5218F6YH22 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5218F6YH22 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5218F6YH22 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5218F6YH22 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5218F6YH22 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5218F6YH22 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5218F6YH22 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5218F6YH22 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5218F6YH22 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5218F6YH22 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5218F6YH22 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5218F6YH22 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5218F6YH22 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5218F6YH22 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5218F6YH22 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5218F6YH22 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5218F6YH22 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5218F6YH22 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5218F6YH22 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5218F6YH22 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5218F6YH22 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5218F6YH22 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5218F6YH22 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5218F6YH22 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5218F6YH22 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5218F6YH22 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5218F6YH22 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5218F6YH22 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5218F6YH22 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5218F6YH22 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5218F6YH22 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5218F6YH22 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5218F6YH22 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5218F6YH22 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5218F6YH22 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5218F6YH22 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5218F6YH22 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5218F6YH22 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5218F6YH22 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms