Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P2

Cacna1i, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1iE9Q7P2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cacna1iE9Q7P2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cacna1iE9Q7P2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cacna1iE9Q7P2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cacna1iE9Q7P2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cacna1iE9Q7P2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacna1iE9Q7P2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacna1iE9Q7P2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacna1iE9Q7P2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacna1iE9Q7P2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacna1iE9Q7P2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacna1iE9Q7P2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacna1iE9Q7P2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacna1iE9Q7P2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacna1iE9Q7P2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacna1iE9Q7P2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacna1iE9Q7P2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacna1iE9Q7P2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacna1iE9Q7P2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacna1iE9Q7P2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna1iE9Q7P2 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna1iE9Q7P2 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna1iE9Q7P2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna1iE9Q7P2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna1iE9Q7P2 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna1iE9Q7P2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna1iE9Q7P2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna1iE9Q7P2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna1iE9Q7P2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna1iE9Q7P2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna1iE9Q7P2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna1iE9Q7P2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna1iE9Q7P2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna1iE9Q7P2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacna1iE9Q7P2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacna1iE9Q7P2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacna1iE9Q7P2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacna1iE9Q7P2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacna1iE9Q7P2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cacna1iE9Q7P2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cacna1iE9Q7P2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cacna1iE9Q7P2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cacna1iE9Q7P2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cacna1iE9Q7P2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cacna1iE9Q7P2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna1iE9Q7P2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna1iE9Q7P2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna1iE9Q7P2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna1iE9Q7P2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna1iE9Q7P2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna1iE9Q7P2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna1iE9Q7P2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1iE9Q7P2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1iE9Q7P2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1iE9Q7P2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1iE9Q7P2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1iE9Q7P2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1iE9Q7P2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1iE9Q7P2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1iE9Q7P2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1iE9Q7P2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1iE9Q7P2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1iE9Q7P2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1iE9Q7P2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1iE9Q7P2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1iE9Q7P2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna1iE9Q7P2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna1iE9Q7P2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna1iE9Q7P2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna1iE9Q7P2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna1iE9Q7P2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna1iE9Q7P2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna1iE9Q7P2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna1iE9Q7P2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna1iE9Q7P2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna1iE9Q7P2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna1iE9Q7P2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna1iE9Q7P2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna1iE9Q7P2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna1iE9Q7P2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna1iE9Q7P2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna1iE9Q7P2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna1iE9Q7P2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna1iE9Q7P2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna1iE9Q7P2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna1iE9Q7P2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna1iE9Q7P2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna1iE9Q7P2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna1iE9Q7P2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna1iE9Q7P2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna1iE9Q7P2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna1iE9Q7P2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna1iE9Q7P2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna1iE9Q7P2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna1iE9Q7P2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna1iE9Q7P2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna1iE9Q7P2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna1iE9Q7P2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna1iE9Q7P2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna1iE9Q7P2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms