Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P1

Col22a1, Collagen, type XXII, alpha 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col22a1E9Q7P1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Col22a1E9Q7P1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Col22a1E9Q7P1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Col22a1E9Q7P1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Col22a1E9Q7P1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Col22a1E9Q7P1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Col22a1E9Q7P1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Col22a1E9Q7P1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Col22a1E9Q7P1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Col22a1E9Q7P1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Col22a1E9Q7P1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Col22a1E9Q7P1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Col22a1E9Q7P1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Col22a1E9Q7P1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Col22a1E9Q7P1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Col22a1E9Q7P1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Col22a1E9Q7P1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Col22a1E9Q7P1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Col22a1E9Q7P1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Col22a1E9Q7P1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Col22a1E9Q7P1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Col22a1E9Q7P1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Col22a1E9Q7P1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Col22a1E9Q7P1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Col22a1E9Q7P1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Col22a1E9Q7P1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Col22a1E9Q7P1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Col22a1E9Q7P1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Col22a1E9Q7P1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Col22a1E9Q7P1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Col22a1E9Q7P1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Col22a1E9Q7P1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Col22a1E9Q7P1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Col22a1E9Q7P1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Col22a1E9Q7P1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Col22a1E9Q7P1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Col22a1E9Q7P1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Col22a1E9Q7P1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Col22a1E9Q7P1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Col22a1E9Q7P1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Col22a1E9Q7P1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Col22a1E9Q7P1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Col22a1E9Q7P1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Col22a1E9Q7P1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Col22a1E9Q7P1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Col22a1E9Q7P1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Col22a1E9Q7P1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Col22a1E9Q7P1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Col22a1E9Q7P1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Col22a1E9Q7P1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Col22a1E9Q7P1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Col22a1E9Q7P1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Col22a1E9Q7P1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Col22a1E9Q7P1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Col22a1E9Q7P1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Col22a1E9Q7P1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Col22a1E9Q7P1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Col22a1E9Q7P1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Col22a1E9Q7P1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Col22a1E9Q7P1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Col22a1E9Q7P1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Col22a1E9Q7P1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Col22a1E9Q7P1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Col22a1E9Q7P1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Col22a1E9Q7P1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Col22a1E9Q7P1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Col22a1E9Q7P1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Col22a1E9Q7P1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Col22a1E9Q7P1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Col22a1E9Q7P1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Col22a1E9Q7P1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Col22a1E9Q7P1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Col22a1E9Q7P1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Col22a1E9Q7P1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Col22a1E9Q7P1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Col22a1E9Q7P1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Col22a1E9Q7P1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Col22a1E9Q7P1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Col22a1E9Q7P1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Col22a1E9Q7P1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Col22a1E9Q7P1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Col22a1E9Q7P1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Col22a1E9Q7P1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Col22a1E9Q7P1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Col22a1E9Q7P1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Col22a1E9Q7P1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Col22a1E9Q7P1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Col22a1E9Q7P1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Col22a1E9Q7P1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Col22a1E9Q7P1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Col22a1E9Q7P1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Col22a1E9Q7P1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Col22a1E9Q7P1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Col22a1E9Q7P1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Col22a1E9Q7P1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Col22a1E9Q7P1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Col22a1E9Q7P1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Col22a1E9Q7P1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Col22a1E9Q7P1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Col22a1E9Q7P1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms