Protein–RNA interactions for Protein: E9Q557

Dsp, Desmoplakin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DspE9Q557 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DspE9Q557 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DspE9Q557 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DspE9Q557 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DspE9Q557 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DspE9Q557 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DspE9Q557 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DspE9Q557 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DspE9Q557 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DspE9Q557 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DspE9Q557 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DspE9Q557 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DspE9Q557 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DspE9Q557 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DspE9Q557 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DspE9Q557 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DspE9Q557 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
DspE9Q557 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DspE9Q557 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DspE9Q557 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DspE9Q557 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DspE9Q557 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DspE9Q557 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DspE9Q557 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DspE9Q557 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DspE9Q557 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
DspE9Q557 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DspE9Q557 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DspE9Q557 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DspE9Q557 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DspE9Q557 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DspE9Q557 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DspE9Q557 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DspE9Q557 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
DspE9Q557 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DspE9Q557 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DspE9Q557 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DspE9Q557 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
DspE9Q557 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DspE9Q557 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DspE9Q557 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DspE9Q557 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DspE9Q557 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DspE9Q557 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DspE9Q557 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DspE9Q557 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DspE9Q557 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DspE9Q557 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DspE9Q557 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DspE9Q557 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
DspE9Q557 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DspE9Q557 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DspE9Q557 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DspE9Q557 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DspE9Q557 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DspE9Q557 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DspE9Q557 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DspE9Q557 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DspE9Q557 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DspE9Q557 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DspE9Q557 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DspE9Q557 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DspE9Q557 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DspE9Q557 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DspE9Q557 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DspE9Q557 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DspE9Q557 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DspE9Q557 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DspE9Q557 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DspE9Q557 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DspE9Q557 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DspE9Q557 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DspE9Q557 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
DspE9Q557 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DspE9Q557 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DspE9Q557 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DspE9Q557 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DspE9Q557 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DspE9Q557 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DspE9Q557 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DspE9Q557 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
DspE9Q557 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DspE9Q557 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DspE9Q557 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
DspE9Q557 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DspE9Q557 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DspE9Q557 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DspE9Q557 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DspE9Q557 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
DspE9Q557 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DspE9Q557 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DspE9Q557 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DspE9Q557 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DspE9Q557 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DspE9Q557 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DspE9Q557 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DspE9Q557 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DspE9Q557 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DspE9Q557 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DspE9Q557 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms