Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Trappc8E9PWG2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Trappc8E9PWG2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Trappc8E9PWG2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Trappc8E9PWG2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Trappc8E9PWG2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Trappc8E9PWG2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Trappc8E9PWG2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Trappc8E9PWG2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.57
Trappc8E9PWG2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Trappc8E9PWG2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Trappc8E9PWG2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Trappc8E9PWG2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Trappc8E9PWG2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Trappc8E9PWG2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
Trappc8E9PWG2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Trappc8E9PWG2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Trappc8E9PWG2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Trappc8E9PWG2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
Trappc8E9PWG2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Trappc8E9PWG2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Trappc8E9PWG2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Trappc8E9PWG2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Trappc8E9PWG2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Trappc8E9PWG2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Trappc8E9PWG2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Trappc8E9PWG2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Trappc8E9PWG2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Trappc8E9PWG2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Trappc8E9PWG2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Trappc8E9PWG2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Trappc8E9PWG2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC31.07■■■□□ 2.57
Trappc8E9PWG2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
Trappc8E9PWG2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC31.07■■■□□ 2.57
Trappc8E9PWG2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Trappc8E9PWG2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Trappc8E9PWG2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Trappc8E9PWG2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
Trappc8E9PWG2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Trappc8E9PWG2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Trappc8E9PWG2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Trappc8E9PWG2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Trappc8E9PWG2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Trappc8E9PWG2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Trappc8E9PWG2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Trappc8E9PWG2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Trappc8E9PWG2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
Trappc8E9PWG2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Trappc8E9PWG2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Trappc8E9PWG2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Trappc8E9PWG2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Trappc8E9PWG2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Trappc8E9PWG2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Trappc8E9PWG2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Trappc8E9PWG2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Trappc8E9PWG2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Trappc8E9PWG2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Trappc8E9PWG2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Trappc8E9PWG2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Trappc8E9PWG2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
Trappc8E9PWG2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Trappc8E9PWG2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Trappc8E9PWG2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
Trappc8E9PWG2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Trappc8E9PWG2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Trappc8E9PWG2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Trappc8E9PWG2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
Trappc8E9PWG2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Trappc8E9PWG2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
Trappc8E9PWG2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Trappc8E9PWG2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Trappc8E9PWG2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Trappc8E9PWG2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Trappc8E9PWG2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Trappc8E9PWG2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Trappc8E9PWG2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Trappc8E9PWG2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Trappc8E9PWG2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Trappc8E9PWG2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Trappc8E9PWG2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Trappc8E9PWG2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Trappc8E9PWG2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
Trappc8E9PWG2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Trappc8E9PWG2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Trappc8E9PWG2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Trappc8E9PWG2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Trappc8E9PWG2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Trappc8E9PWG2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
Trappc8E9PWG2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Trappc8E9PWG2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
Trappc8E9PWG2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Trappc8E9PWG2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Trappc8E9PWG2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Trappc8E9PWG2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Trappc8E9PWG2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
Trappc8E9PWG2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Trappc8E9PWG2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Trappc8E9PWG2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Trappc8E9PWG2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Trappc8E9PWG2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms