Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim12cD3Z3L3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim12cD3Z3L3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim12cD3Z3L3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim12cD3Z3L3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim12cD3Z3L3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim12cD3Z3L3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim12cD3Z3L3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim12cD3Z3L3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim12cD3Z3L3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim12cD3Z3L3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim12cD3Z3L3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim12cD3Z3L3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim12cD3Z3L3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim12cD3Z3L3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim12cD3Z3L3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim12cD3Z3L3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim12cD3Z3L3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim12cD3Z3L3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim12cD3Z3L3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim12cD3Z3L3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim12cD3Z3L3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim12cD3Z3L3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim12cD3Z3L3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim12cD3Z3L3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim12cD3Z3L3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim12cD3Z3L3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim12cD3Z3L3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim12cD3Z3L3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim12cD3Z3L3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim12cD3Z3L3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim12cD3Z3L3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim12cD3Z3L3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim12cD3Z3L3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim12cD3Z3L3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim12cD3Z3L3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim12cD3Z3L3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim12cD3Z3L3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim12cD3Z3L3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim12cD3Z3L3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim12cD3Z3L3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim12cD3Z3L3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim12cD3Z3L3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim12cD3Z3L3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim12cD3Z3L3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim12cD3Z3L3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim12cD3Z3L3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim12cD3Z3L3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim12cD3Z3L3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim12cD3Z3L3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim12cD3Z3L3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim12cD3Z3L3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim12cD3Z3L3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim12cD3Z3L3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim12cD3Z3L3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim12cD3Z3L3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim12cD3Z3L3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim12cD3Z3L3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim12cD3Z3L3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trim12cD3Z3L3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trim12cD3Z3L3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim12cD3Z3L3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim12cD3Z3L3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim12cD3Z3L3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim12cD3Z3L3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim12cD3Z3L3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim12cD3Z3L3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim12cD3Z3L3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim12cD3Z3L3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim12cD3Z3L3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim12cD3Z3L3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim12cD3Z3L3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim12cD3Z3L3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim12cD3Z3L3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim12cD3Z3L3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim12cD3Z3L3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim12cD3Z3L3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim12cD3Z3L3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim12cD3Z3L3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim12cD3Z3L3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim12cD3Z3L3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim12cD3Z3L3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim12cD3Z3L3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim12cD3Z3L3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim12cD3Z3L3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim12cD3Z3L3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim12cD3Z3L3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim12cD3Z3L3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim12cD3Z3L3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim12cD3Z3L3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim12cD3Z3L3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim12cD3Z3L3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim12cD3Z3L3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim12cD3Z3L3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim12cD3Z3L3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim12cD3Z3L3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim12cD3Z3L3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim12cD3Z3L3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim12cD3Z3L3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim12cD3Z3L3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms