Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1D3

3425401B19Rik, RIKEN cDNA 3425401B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3425401B19RikD3Z1D3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
3425401B19RikD3Z1D3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
3425401B19RikD3Z1D3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
3425401B19RikD3Z1D3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
3425401B19RikD3Z1D3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
3425401B19RikD3Z1D3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
3425401B19RikD3Z1D3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
3425401B19RikD3Z1D3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
3425401B19RikD3Z1D3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
3425401B19RikD3Z1D3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
3425401B19RikD3Z1D3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
3425401B19RikD3Z1D3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
3425401B19RikD3Z1D3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
3425401B19RikD3Z1D3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC31.2■■■□□ 2.59
3425401B19RikD3Z1D3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
3425401B19RikD3Z1D3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
3425401B19RikD3Z1D3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
3425401B19RikD3Z1D3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
3425401B19RikD3Z1D3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
3425401B19RikD3Z1D3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
3425401B19RikD3Z1D3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
3425401B19RikD3Z1D3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC31.19■■■□□ 2.58
3425401B19RikD3Z1D3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
3425401B19RikD3Z1D3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
3425401B19RikD3Z1D3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
3425401B19RikD3Z1D3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
3425401B19RikD3Z1D3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
3425401B19RikD3Z1D3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
3425401B19RikD3Z1D3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
3425401B19RikD3Z1D3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
3425401B19RikD3Z1D3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
3425401B19RikD3Z1D3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
3425401B19RikD3Z1D3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
3425401B19RikD3Z1D3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
3425401B19RikD3Z1D3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
3425401B19RikD3Z1D3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
3425401B19RikD3Z1D3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
3425401B19RikD3Z1D3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
3425401B19RikD3Z1D3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC31.15■■■□□ 2.58
3425401B19RikD3Z1D3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
3425401B19RikD3Z1D3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
3425401B19RikD3Z1D3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
3425401B19RikD3Z1D3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
3425401B19RikD3Z1D3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
3425401B19RikD3Z1D3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
3425401B19RikD3Z1D3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
3425401B19RikD3Z1D3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
3425401B19RikD3Z1D3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
3425401B19RikD3Z1D3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
3425401B19RikD3Z1D3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
3425401B19RikD3Z1D3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
3425401B19RikD3Z1D3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
3425401B19RikD3Z1D3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
3425401B19RikD3Z1D3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
3425401B19RikD3Z1D3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
3425401B19RikD3Z1D3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
3425401B19RikD3Z1D3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
3425401B19RikD3Z1D3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
3425401B19RikD3Z1D3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
3425401B19RikD3Z1D3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
3425401B19RikD3Z1D3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
3425401B19RikD3Z1D3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
3425401B19RikD3Z1D3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
3425401B19RikD3Z1D3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
3425401B19RikD3Z1D3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
3425401B19RikD3Z1D3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
3425401B19RikD3Z1D3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
3425401B19RikD3Z1D3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
3425401B19RikD3Z1D3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
3425401B19RikD3Z1D3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
3425401B19RikD3Z1D3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
3425401B19RikD3Z1D3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
3425401B19RikD3Z1D3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
3425401B19RikD3Z1D3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
3425401B19RikD3Z1D3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
3425401B19RikD3Z1D3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.57
3425401B19RikD3Z1D3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
3425401B19RikD3Z1D3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC31.07■■■□□ 2.56
3425401B19RikD3Z1D3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
3425401B19RikD3Z1D3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
3425401B19RikD3Z1D3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
3425401B19RikD3Z1D3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
3425401B19RikD3Z1D3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
3425401B19RikD3Z1D3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
3425401B19RikD3Z1D3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
3425401B19RikD3Z1D3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
3425401B19RikD3Z1D3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
3425401B19RikD3Z1D3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
3425401B19RikD3Z1D3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
3425401B19RikD3Z1D3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
3425401B19RikD3Z1D3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
3425401B19RikD3Z1D3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
3425401B19RikD3Z1D3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
3425401B19RikD3Z1D3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
3425401B19RikD3Z1D3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
3425401B19RikD3Z1D3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
3425401B19RikD3Z1D3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
3425401B19RikD3Z1D3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
3425401B19RikD3Z1D3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
3425401B19RikD3Z1D3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 465.3 ms