Protein–RNA interactions for Protein: D3YY23

Lonrf1, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 1, mousemouse

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Length 762 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf1D3YY23 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lonrf1D3YY23 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lonrf1D3YY23 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lonrf1D3YY23 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Lonrf1D3YY23 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Lonrf1D3YY23 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lonrf1D3YY23 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Lonrf1D3YY23 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lonrf1D3YY23 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lonrf1D3YY23 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lonrf1D3YY23 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lonrf1D3YY23 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lonrf1D3YY23 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lonrf1D3YY23 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lonrf1D3YY23 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lonrf1D3YY23 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lonrf1D3YY23 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lonrf1D3YY23 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lonrf1D3YY23 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lonrf1D3YY23 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lonrf1D3YY23 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lonrf1D3YY23 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lonrf1D3YY23 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lonrf1D3YY23 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lonrf1D3YY23 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lonrf1D3YY23 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lonrf1D3YY23 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lonrf1D3YY23 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lonrf1D3YY23 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lonrf1D3YY23 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lonrf1D3YY23 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lonrf1D3YY23 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lonrf1D3YY23 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lonrf1D3YY23 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lonrf1D3YY23 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lonrf1D3YY23 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lonrf1D3YY23 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lonrf1D3YY23 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lonrf1D3YY23 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lonrf1D3YY23 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lonrf1D3YY23 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lonrf1D3YY23 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lonrf1D3YY23 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lonrf1D3YY23 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lonrf1D3YY23 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lonrf1D3YY23 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lonrf1D3YY23 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lonrf1D3YY23 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lonrf1D3YY23 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Lonrf1D3YY23 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lonrf1D3YY23 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lonrf1D3YY23 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lonrf1D3YY23 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lonrf1D3YY23 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lonrf1D3YY23 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lonrf1D3YY23 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lonrf1D3YY23 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lonrf1D3YY23 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lonrf1D3YY23 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lonrf1D3YY23 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lonrf1D3YY23 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lonrf1D3YY23 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lonrf1D3YY23 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lonrf1D3YY23 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lonrf1D3YY23 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lonrf1D3YY23 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lonrf1D3YY23 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lonrf1D3YY23 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lonrf1D3YY23 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lonrf1D3YY23 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lonrf1D3YY23 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lonrf1D3YY23 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lonrf1D3YY23 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lonrf1D3YY23 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lonrf1D3YY23 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lonrf1D3YY23 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lonrf1D3YY23 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lonrf1D3YY23 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lonrf1D3YY23 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lonrf1D3YY23 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lonrf1D3YY23 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lonrf1D3YY23 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lonrf1D3YY23 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lonrf1D3YY23 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lonrf1D3YY23 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Lonrf1D3YY23 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lonrf1D3YY23 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lonrf1D3YY23 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lonrf1D3YY23 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lonrf1D3YY23 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lonrf1D3YY23 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lonrf1D3YY23 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lonrf1D3YY23 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lonrf1D3YY23 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lonrf1D3YY23 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lonrf1D3YY23 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Lonrf1D3YY23 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Lonrf1D3YY23 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lonrf1D3YY23 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lonrf1D3YY23 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms