Protein–RNA interactions for Protein: D3YWW5

Rtl10, Retrotransposon Gag-like 10, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl10D3YWW5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rtl10D3YWW5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rtl10D3YWW5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rtl10D3YWW5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rtl10D3YWW5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl10D3YWW5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl10D3YWW5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl10D3YWW5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl10D3YWW5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl10D3YWW5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl10D3YWW5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl10D3YWW5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl10D3YWW5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl10D3YWW5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl10D3YWW5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl10D3YWW5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl10D3YWW5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl10D3YWW5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl10D3YWW5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl10D3YWW5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl10D3YWW5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl10D3YWW5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl10D3YWW5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl10D3YWW5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl10D3YWW5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl10D3YWW5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl10D3YWW5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl10D3YWW5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl10D3YWW5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl10D3YWW5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl10D3YWW5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl10D3YWW5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl10D3YWW5 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl10D3YWW5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl10D3YWW5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl10D3YWW5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl10D3YWW5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl10D3YWW5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl10D3YWW5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl10D3YWW5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl10D3YWW5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl10D3YWW5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl10D3YWW5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl10D3YWW5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl10D3YWW5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl10D3YWW5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl10D3YWW5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl10D3YWW5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl10D3YWW5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl10D3YWW5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl10D3YWW5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl10D3YWW5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl10D3YWW5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl10D3YWW5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl10D3YWW5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl10D3YWW5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl10D3YWW5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl10D3YWW5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl10D3YWW5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl10D3YWW5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl10D3YWW5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl10D3YWW5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl10D3YWW5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl10D3YWW5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtl10D3YWW5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtl10D3YWW5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtl10D3YWW5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtl10D3YWW5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtl10D3YWW5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtl10D3YWW5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtl10D3YWW5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtl10D3YWW5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtl10D3YWW5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtl10D3YWW5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtl10D3YWW5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtl10D3YWW5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtl10D3YWW5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtl10D3YWW5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtl10D3YWW5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtl10D3YWW5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtl10D3YWW5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtl10D3YWW5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtl10D3YWW5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtl10D3YWW5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtl10D3YWW5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtl10D3YWW5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtl10D3YWW5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtl10D3YWW5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtl10D3YWW5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtl10D3YWW5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtl10D3YWW5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtl10D3YWW5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtl10D3YWW5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtl10D3YWW5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtl10D3YWW5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtl10D3YWW5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtl10D3YWW5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtl10D3YWW5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtl10D3YWW5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtl10D3YWW5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.1 ms