Protein–RNA interactions for Protein: D3YUR1

4930444P10Rik, RIKEN cDNA 4930444P10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930444P10RikD3YUR1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930444P10RikD3YUR1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930444P10RikD3YUR1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930444P10RikD3YUR1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930444P10RikD3YUR1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930444P10RikD3YUR1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930444P10RikD3YUR1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930444P10RikD3YUR1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930444P10RikD3YUR1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930444P10RikD3YUR1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930444P10RikD3YUR1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
4930444P10RikD3YUR1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930444P10RikD3YUR1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930444P10RikD3YUR1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930444P10RikD3YUR1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930444P10RikD3YUR1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930444P10RikD3YUR1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930444P10RikD3YUR1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930444P10RikD3YUR1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
4930444P10RikD3YUR1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930444P10RikD3YUR1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930444P10RikD3YUR1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930444P10RikD3YUR1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930444P10RikD3YUR1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930444P10RikD3YUR1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
4930444P10RikD3YUR1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930444P10RikD3YUR1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930444P10RikD3YUR1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930444P10RikD3YUR1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930444P10RikD3YUR1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930444P10RikD3YUR1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930444P10RikD3YUR1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930444P10RikD3YUR1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930444P10RikD3YUR1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
4930444P10RikD3YUR1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930444P10RikD3YUR1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930444P10RikD3YUR1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930444P10RikD3YUR1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930444P10RikD3YUR1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930444P10RikD3YUR1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930444P10RikD3YUR1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930444P10RikD3YUR1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930444P10RikD3YUR1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930444P10RikD3YUR1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930444P10RikD3YUR1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4930444P10RikD3YUR1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4930444P10RikD3YUR1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
4930444P10RikD3YUR1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
4930444P10RikD3YUR1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
4930444P10RikD3YUR1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4930444P10RikD3YUR1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4930444P10RikD3YUR1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
4930444P10RikD3YUR1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
4930444P10RikD3YUR1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
4930444P10RikD3YUR1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930444P10RikD3YUR1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930444P10RikD3YUR1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930444P10RikD3YUR1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930444P10RikD3YUR1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930444P10RikD3YUR1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930444P10RikD3YUR1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930444P10RikD3YUR1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930444P10RikD3YUR1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930444P10RikD3YUR1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930444P10RikD3YUR1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930444P10RikD3YUR1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930444P10RikD3YUR1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930444P10RikD3YUR1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930444P10RikD3YUR1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930444P10RikD3YUR1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930444P10RikD3YUR1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930444P10RikD3YUR1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930444P10RikD3YUR1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930444P10RikD3YUR1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930444P10RikD3YUR1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930444P10RikD3YUR1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
4930444P10RikD3YUR1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930444P10RikD3YUR1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930444P10RikD3YUR1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
4930444P10RikD3YUR1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930444P10RikD3YUR1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930444P10RikD3YUR1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930444P10RikD3YUR1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930444P10RikD3YUR1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930444P10RikD3YUR1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930444P10RikD3YUR1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930444P10RikD3YUR1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930444P10RikD3YUR1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930444P10RikD3YUR1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930444P10RikD3YUR1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930444P10RikD3YUR1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930444P10RikD3YUR1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930444P10RikD3YUR1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930444P10RikD3YUR1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930444P10RikD3YUR1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930444P10RikD3YUR1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930444P10RikD3YUR1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930444P10RikD3YUR1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930444P10RikD3YUR1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930444P10RikD3YUR1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms