Protein–RNA interactions for Protein: B9EKR1

Ptprz1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, mousemouse

Predictions only

Length 2,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprz1B9EKR1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ptprz1B9EKR1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ptprz1B9EKR1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ptprz1B9EKR1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ptprz1B9EKR1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ptprz1B9EKR1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ptprz1B9EKR1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ptprz1B9EKR1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ptprz1B9EKR1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ptprz1B9EKR1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ptprz1B9EKR1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ptprz1B9EKR1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ptprz1B9EKR1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ptprz1B9EKR1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ptprz1B9EKR1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ptprz1B9EKR1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ptprz1B9EKR1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ptprz1B9EKR1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ptprz1B9EKR1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ptprz1B9EKR1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ptprz1B9EKR1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ptprz1B9EKR1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ptprz1B9EKR1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ptprz1B9EKR1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ptprz1B9EKR1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ptprz1B9EKR1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ptprz1B9EKR1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ptprz1B9EKR1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ptprz1B9EKR1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ptprz1B9EKR1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ptprz1B9EKR1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ptprz1B9EKR1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ptprz1B9EKR1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ptprz1B9EKR1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ptprz1B9EKR1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ptprz1B9EKR1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ptprz1B9EKR1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ptprz1B9EKR1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ptprz1B9EKR1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ptprz1B9EKR1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ptprz1B9EKR1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ptprz1B9EKR1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ptprz1B9EKR1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ptprz1B9EKR1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ptprz1B9EKR1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ptprz1B9EKR1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ptprz1B9EKR1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ptprz1B9EKR1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ptprz1B9EKR1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ptprz1B9EKR1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ptprz1B9EKR1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ptprz1B9EKR1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptprz1B9EKR1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptprz1B9EKR1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptprz1B9EKR1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptprz1B9EKR1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptprz1B9EKR1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptprz1B9EKR1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptprz1B9EKR1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptprz1B9EKR1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ptprz1B9EKR1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ptprz1B9EKR1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ptprz1B9EKR1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ptprz1B9EKR1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ptprz1B9EKR1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
Ptprz1B9EKR1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ptprz1B9EKR1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ptprz1B9EKR1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ptprz1B9EKR1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ptprz1B9EKR1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ptprz1B9EKR1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ptprz1B9EKR1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ptprz1B9EKR1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ptprz1B9EKR1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ptprz1B9EKR1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ptprz1B9EKR1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ptprz1B9EKR1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ptprz1B9EKR1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ptprz1B9EKR1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ptprz1B9EKR1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ptprz1B9EKR1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ptprz1B9EKR1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ptprz1B9EKR1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ptprz1B9EKR1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ptprz1B9EKR1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ptprz1B9EKR1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ptprz1B9EKR1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ptprz1B9EKR1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ptprz1B9EKR1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ptprz1B9EKR1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ptprz1B9EKR1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ptprz1B9EKR1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ptprz1B9EKR1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ptprz1B9EKR1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ptprz1B9EKR1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ptprz1B9EKR1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ptprz1B9EKR1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ptprz1B9EKR1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ptprz1B9EKR1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ptprz1B9EKR1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms