Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tmf1B9EKI3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tmf1B9EKI3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tmf1B9EKI3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tmf1B9EKI3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tmf1B9EKI3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tmf1B9EKI3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tmf1B9EKI3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tmf1B9EKI3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tmf1B9EKI3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tmf1B9EKI3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tmf1B9EKI3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tmf1B9EKI3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tmf1B9EKI3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tmf1B9EKI3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tmf1B9EKI3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tmf1B9EKI3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tmf1B9EKI3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tmf1B9EKI3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tmf1B9EKI3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Tmf1B9EKI3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tmf1B9EKI3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tmf1B9EKI3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tmf1B9EKI3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tmf1B9EKI3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tmf1B9EKI3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tmf1B9EKI3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tmf1B9EKI3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tmf1B9EKI3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tmf1B9EKI3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tmf1B9EKI3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Tmf1B9EKI3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Tmf1B9EKI3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Tmf1B9EKI3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tmf1B9EKI3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tmf1B9EKI3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tmf1B9EKI3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tmf1B9EKI3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tmf1B9EKI3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tmf1B9EKI3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tmf1B9EKI3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tmf1B9EKI3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tmf1B9EKI3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tmf1B9EKI3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tmf1B9EKI3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tmf1B9EKI3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tmf1B9EKI3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tmf1B9EKI3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tmf1B9EKI3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tmf1B9EKI3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Tmf1B9EKI3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tmf1B9EKI3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tmf1B9EKI3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tmf1B9EKI3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tmf1B9EKI3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tmf1B9EKI3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tmf1B9EKI3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tmf1B9EKI3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tmf1B9EKI3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tmf1B9EKI3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Tmf1B9EKI3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tmf1B9EKI3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tmf1B9EKI3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tmf1B9EKI3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tmf1B9EKI3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tmf1B9EKI3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tmf1B9EKI3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Tmf1B9EKI3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Tmf1B9EKI3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Tmf1B9EKI3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Tmf1B9EKI3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Tmf1B9EKI3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tmf1B9EKI3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tmf1B9EKI3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tmf1B9EKI3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tmf1B9EKI3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tmf1B9EKI3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tmf1B9EKI3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Tmf1B9EKI3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Tmf1B9EKI3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tmf1B9EKI3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tmf1B9EKI3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tmf1B9EKI3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tmf1B9EKI3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tmf1B9EKI3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Tmf1B9EKI3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tmf1B9EKI3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tmf1B9EKI3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tmf1B9EKI3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tmf1B9EKI3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tmf1B9EKI3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Tmf1B9EKI3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tmf1B9EKI3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tmf1B9EKI3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tmf1B9EKI3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tmf1B9EKI3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tmf1B9EKI3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Tmf1B9EKI3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Tmf1B9EKI3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tmf1B9EKI3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.7 ms