Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PtprbB2RU80 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PtprbB2RU80 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PtprbB2RU80 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PtprbB2RU80 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PtprbB2RU80 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PtprbB2RU80 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PtprbB2RU80 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PtprbB2RU80 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PtprbB2RU80 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PtprbB2RU80 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PtprbB2RU80 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PtprbB2RU80 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PtprbB2RU80 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PtprbB2RU80 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PtprbB2RU80 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PtprbB2RU80 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PtprbB2RU80 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PtprbB2RU80 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PtprbB2RU80 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PtprbB2RU80 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PtprbB2RU80 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PtprbB2RU80 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PtprbB2RU80 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PtprbB2RU80 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PtprbB2RU80 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PtprbB2RU80 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PtprbB2RU80 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PtprbB2RU80 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PtprbB2RU80 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PtprbB2RU80 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PtprbB2RU80 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PtprbB2RU80 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PtprbB2RU80 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PtprbB2RU80 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PtprbB2RU80 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PtprbB2RU80 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PtprbB2RU80 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PtprbB2RU80 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PtprbB2RU80 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PtprbB2RU80 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PtprbB2RU80 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PtprbB2RU80 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PtprbB2RU80 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PtprbB2RU80 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PtprbB2RU80 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PtprbB2RU80 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PtprbB2RU80 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PtprbB2RU80 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtprbB2RU80 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtprbB2RU80 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtprbB2RU80 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtprbB2RU80 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtprbB2RU80 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtprbB2RU80 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtprbB2RU80 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtprbB2RU80 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtprbB2RU80 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtprbB2RU80 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtprbB2RU80 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtprbB2RU80 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PtprbB2RU80 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtprbB2RU80 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtprbB2RU80 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtprbB2RU80 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtprbB2RU80 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprbB2RU80 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprbB2RU80 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprbB2RU80 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprbB2RU80 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprbB2RU80 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprbB2RU80 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprbB2RU80 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprbB2RU80 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprbB2RU80 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprbB2RU80 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprbB2RU80 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprbB2RU80 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprbB2RU80 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprbB2RU80 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprbB2RU80 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprbB2RU80 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprbB2RU80 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprbB2RU80 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprbB2RU80 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprbB2RU80 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprbB2RU80 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprbB2RU80 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprbB2RU80 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtprbB2RU80 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtprbB2RU80 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtprbB2RU80 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PtprbB2RU80 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtprbB2RU80 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtprbB2RU80 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PtprbB2RU80 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PtprbB2RU80 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PtprbB2RU80 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PtprbB2RU80 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprbB2RU80 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141.6 ms