Protein–RNA interactions for Protein: B2RQC2

Usp42, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp42B2RQC2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp42B2RQC2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp42B2RQC2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp42B2RQC2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp42B2RQC2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp42B2RQC2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp42B2RQC2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp42B2RQC2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp42B2RQC2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp42B2RQC2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp42B2RQC2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp42B2RQC2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp42B2RQC2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp42B2RQC2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp42B2RQC2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp42B2RQC2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp42B2RQC2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp42B2RQC2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp42B2RQC2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp42B2RQC2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp42B2RQC2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp42B2RQC2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp42B2RQC2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp42B2RQC2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp42B2RQC2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp42B2RQC2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp42B2RQC2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp42B2RQC2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp42B2RQC2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp42B2RQC2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp42B2RQC2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Usp42B2RQC2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp42B2RQC2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp42B2RQC2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp42B2RQC2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp42B2RQC2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp42B2RQC2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp42B2RQC2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp42B2RQC2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp42B2RQC2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp42B2RQC2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp42B2RQC2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp42B2RQC2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp42B2RQC2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp42B2RQC2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp42B2RQC2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp42B2RQC2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp42B2RQC2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp42B2RQC2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp42B2RQC2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp42B2RQC2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp42B2RQC2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp42B2RQC2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp42B2RQC2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp42B2RQC2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp42B2RQC2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp42B2RQC2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp42B2RQC2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp42B2RQC2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp42B2RQC2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp42B2RQC2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp42B2RQC2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp42B2RQC2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp42B2RQC2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp42B2RQC2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp42B2RQC2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp42B2RQC2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp42B2RQC2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp42B2RQC2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp42B2RQC2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Usp42B2RQC2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Usp42B2RQC2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Usp42B2RQC2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Usp42B2RQC2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Usp42B2RQC2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Usp42B2RQC2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Usp42B2RQC2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp42B2RQC2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp42B2RQC2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp42B2RQC2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp42B2RQC2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp42B2RQC2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp42B2RQC2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp42B2RQC2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp42B2RQC2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp42B2RQC2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp42B2RQC2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp42B2RQC2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp42B2RQC2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp42B2RQC2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp42B2RQC2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp42B2RQC2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp42B2RQC2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp42B2RQC2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp42B2RQC2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp42B2RQC2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp42B2RQC2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp42B2RQC2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp42B2RQC2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp42B2RQC2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms