Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Brpf3B2KF05 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Brpf3B2KF05 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Brpf3B2KF05 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Brpf3B2KF05 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Brpf3B2KF05 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Brpf3B2KF05 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Brpf3B2KF05 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Brpf3B2KF05 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Brpf3B2KF05 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Brpf3B2KF05 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Brpf3B2KF05 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Brpf3B2KF05 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Brpf3B2KF05 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Brpf3B2KF05 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Brpf3B2KF05 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Brpf3B2KF05 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Brpf3B2KF05 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Brpf3B2KF05 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Brpf3B2KF05 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Brpf3B2KF05 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Brpf3B2KF05 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Brpf3B2KF05 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Brpf3B2KF05 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Brpf3B2KF05 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Brpf3B2KF05 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Brpf3B2KF05 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Brpf3B2KF05 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Brpf3B2KF05 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Brpf3B2KF05 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Brpf3B2KF05 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Brpf3B2KF05 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Brpf3B2KF05 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Brpf3B2KF05 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Brpf3B2KF05 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Brpf3B2KF05 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Brpf3B2KF05 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Brpf3B2KF05 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Brpf3B2KF05 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Brpf3B2KF05 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Brpf3B2KF05 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Brpf3B2KF05 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Brpf3B2KF05 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Brpf3B2KF05 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Brpf3B2KF05 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Brpf3B2KF05 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Brpf3B2KF05 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Brpf3B2KF05 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Brpf3B2KF05 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Brpf3B2KF05 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Brpf3B2KF05 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Brpf3B2KF05 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Brpf3B2KF05 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Brpf3B2KF05 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Brpf3B2KF05 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Brpf3B2KF05 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Brpf3B2KF05 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Brpf3B2KF05 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Brpf3B2KF05 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Brpf3B2KF05 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Brpf3B2KF05 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Brpf3B2KF05 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Brpf3B2KF05 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Brpf3B2KF05 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Brpf3B2KF05 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Brpf3B2KF05 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Brpf3B2KF05 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Brpf3B2KF05 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Brpf3B2KF05 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Brpf3B2KF05 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Brpf3B2KF05 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Brpf3B2KF05 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Brpf3B2KF05 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Brpf3B2KF05 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Brpf3B2KF05 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Brpf3B2KF05 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Brpf3B2KF05 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Brpf3B2KF05 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Brpf3B2KF05 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Brpf3B2KF05 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Brpf3B2KF05 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Brpf3B2KF05 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Brpf3B2KF05 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Brpf3B2KF05 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Brpf3B2KF05 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Brpf3B2KF05 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Brpf3B2KF05 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Brpf3B2KF05 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Brpf3B2KF05 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Brpf3B2KF05 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Brpf3B2KF05 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Brpf3B2KF05 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Brpf3B2KF05 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Brpf3B2KF05 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Brpf3B2KF05 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Brpf3B2KF05 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Brpf3B2KF05 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Brpf3B2KF05 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Brpf3B2KF05 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Brpf3B2KF05 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.6 ms