Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trabd2bB1ATG9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trabd2bB1ATG9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Trabd2bB1ATG9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trabd2bB1ATG9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trabd2bB1ATG9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trabd2bB1ATG9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trabd2bB1ATG9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trabd2bB1ATG9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trabd2bB1ATG9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trabd2bB1ATG9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trabd2bB1ATG9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Trabd2bB1ATG9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trabd2bB1ATG9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trabd2bB1ATG9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trabd2bB1ATG9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trabd2bB1ATG9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trabd2bB1ATG9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trabd2bB1ATG9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trabd2bB1ATG9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trabd2bB1ATG9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trabd2bB1ATG9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trabd2bB1ATG9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trabd2bB1ATG9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trabd2bB1ATG9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trabd2bB1ATG9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trabd2bB1ATG9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trabd2bB1ATG9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trabd2bB1ATG9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trabd2bB1ATG9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trabd2bB1ATG9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trabd2bB1ATG9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trabd2bB1ATG9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trabd2bB1ATG9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trabd2bB1ATG9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trabd2bB1ATG9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trabd2bB1ATG9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trabd2bB1ATG9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trabd2bB1ATG9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trabd2bB1ATG9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trabd2bB1ATG9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trabd2bB1ATG9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trabd2bB1ATG9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trabd2bB1ATG9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trabd2bB1ATG9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Trabd2bB1ATG9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trabd2bB1ATG9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trabd2bB1ATG9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Trabd2bB1ATG9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trabd2bB1ATG9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trabd2bB1ATG9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trabd2bB1ATG9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trabd2bB1ATG9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trabd2bB1ATG9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trabd2bB1ATG9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trabd2bB1ATG9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trabd2bB1ATG9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trabd2bB1ATG9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trabd2bB1ATG9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trabd2bB1ATG9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trabd2bB1ATG9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trabd2bB1ATG9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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Trabd2bB1ATG9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trabd2bB1ATG9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trabd2bB1ATG9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trabd2bB1ATG9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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Trabd2bB1ATG9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trabd2bB1ATG9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trabd2bB1ATG9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trabd2bB1ATG9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trabd2bB1ATG9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trabd2bB1ATG9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trabd2bB1ATG9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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Trabd2bB1ATG9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trabd2bB1ATG9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trabd2bB1ATG9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Trabd2bB1ATG9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trabd2bB1ATG9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trabd2bB1ATG9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trabd2bB1ATG9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trabd2bB1ATG9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trabd2bB1ATG9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trabd2bB1ATG9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trabd2bB1ATG9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trabd2bB1ATG9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trabd2bB1ATG9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trabd2bB1ATG9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trabd2bB1ATG9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trabd2bB1ATG9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trabd2bB1ATG9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trabd2bB1ATG9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trabd2bB1ATG9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trabd2bB1ATG9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms