Protein–RNA interactions for Protein: A2ALK8

Ptpn3, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 3, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn3A2ALK8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ptpn3A2ALK8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ptpn3A2ALK8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ptpn3A2ALK8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ptpn3A2ALK8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ptpn3A2ALK8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ptpn3A2ALK8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ptpn3A2ALK8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ptpn3A2ALK8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ptpn3A2ALK8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ptpn3A2ALK8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ptpn3A2ALK8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ptpn3A2ALK8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ptpn3A2ALK8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ptpn3A2ALK8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ptpn3A2ALK8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ptpn3A2ALK8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ptpn3A2ALK8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ptpn3A2ALK8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ptpn3A2ALK8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ptpn3A2ALK8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ptpn3A2ALK8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ptpn3A2ALK8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ptpn3A2ALK8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ptpn3A2ALK8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ptpn3A2ALK8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ptpn3A2ALK8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ptpn3A2ALK8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ptpn3A2ALK8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ptpn3A2ALK8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ptpn3A2ALK8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ptpn3A2ALK8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ptpn3A2ALK8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ptpn3A2ALK8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ptpn3A2ALK8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ptpn3A2ALK8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ptpn3A2ALK8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ptpn3A2ALK8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ptpn3A2ALK8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ptpn3A2ALK8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ptpn3A2ALK8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ptpn3A2ALK8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ptpn3A2ALK8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ptpn3A2ALK8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ptpn3A2ALK8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ptpn3A2ALK8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ptpn3A2ALK8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ptpn3A2ALK8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ptpn3A2ALK8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ptpn3A2ALK8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ptpn3A2ALK8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ptpn3A2ALK8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ptpn3A2ALK8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ptpn3A2ALK8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ptpn3A2ALK8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ptpn3A2ALK8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ptpn3A2ALK8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ptpn3A2ALK8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ptpn3A2ALK8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ptpn3A2ALK8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ptpn3A2ALK8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ptpn3A2ALK8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ptpn3A2ALK8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ptpn3A2ALK8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ptpn3A2ALK8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ptpn3A2ALK8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ptpn3A2ALK8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ptpn3A2ALK8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ptpn3A2ALK8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ptpn3A2ALK8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ptpn3A2ALK8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ptpn3A2ALK8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ptpn3A2ALK8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ptpn3A2ALK8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ptpn3A2ALK8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ptpn3A2ALK8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ptpn3A2ALK8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ptpn3A2ALK8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ptpn3A2ALK8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ptpn3A2ALK8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ptpn3A2ALK8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ptpn3A2ALK8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ptpn3A2ALK8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ptpn3A2ALK8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ptpn3A2ALK8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ptpn3A2ALK8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ptpn3A2ALK8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ptpn3A2ALK8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ptpn3A2ALK8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ptpn3A2ALK8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ptpn3A2ALK8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ptpn3A2ALK8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ptpn3A2ALK8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ptpn3A2ALK8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ptpn3A2ALK8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ptpn3A2ALK8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ptpn3A2ALK8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ptpn3A2ALK8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ptpn3A2ALK8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ptpn3A2ALK8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms