Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ38

Gm13941, Predicted gene 13941 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm13941A2AJ38 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm13941A2AJ38 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm13941A2AJ38 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm13941A2AJ38 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm13941A2AJ38 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm13941A2AJ38 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm13941A2AJ38 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm13941A2AJ38 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm13941A2AJ38 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm13941A2AJ38 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm13941A2AJ38 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm13941A2AJ38 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm13941A2AJ38 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm13941A2AJ38 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm13941A2AJ38 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm13941A2AJ38 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm13941A2AJ38 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm13941A2AJ38 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm13941A2AJ38 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm13941A2AJ38 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm13941A2AJ38 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm13941A2AJ38 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm13941A2AJ38 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm13941A2AJ38 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm13941A2AJ38 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm13941A2AJ38 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm13941A2AJ38 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm13941A2AJ38 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm13941A2AJ38 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm13941A2AJ38 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm13941A2AJ38 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm13941A2AJ38 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm13941A2AJ38 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm13941A2AJ38 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm13941A2AJ38 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm13941A2AJ38 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm13941A2AJ38 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm13941A2AJ38 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm13941A2AJ38 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm13941A2AJ38 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm13941A2AJ38 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm13941A2AJ38 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm13941A2AJ38 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm13941A2AJ38 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm13941A2AJ38 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm13941A2AJ38 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm13941A2AJ38 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm13941A2AJ38 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm13941A2AJ38 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm13941A2AJ38 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm13941A2AJ38 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm13941A2AJ38 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm13941A2AJ38 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm13941A2AJ38 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm13941A2AJ38 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm13941A2AJ38 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm13941A2AJ38 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm13941A2AJ38 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm13941A2AJ38 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm13941A2AJ38 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm13941A2AJ38 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm13941A2AJ38 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm13941A2AJ38 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm13941A2AJ38 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm13941A2AJ38 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm13941A2AJ38 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm13941A2AJ38 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm13941A2AJ38 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm13941A2AJ38 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm13941A2AJ38 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm13941A2AJ38 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm13941A2AJ38 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm13941A2AJ38 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm13941A2AJ38 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm13941A2AJ38 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm13941A2AJ38 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm13941A2AJ38 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm13941A2AJ38 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm13941A2AJ38 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm13941A2AJ38 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm13941A2AJ38 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm13941A2AJ38 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm13941A2AJ38 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm13941A2AJ38 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm13941A2AJ38 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm13941A2AJ38 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm13941A2AJ38 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm13941A2AJ38 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm13941A2AJ38 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm13941A2AJ38 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm13941A2AJ38 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm13941A2AJ38 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm13941A2AJ38 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm13941A2AJ38 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm13941A2AJ38 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm13941A2AJ38 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm13941A2AJ38 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm13941A2AJ38 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm13941A2AJ38 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm13941A2AJ38 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms