Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Col9a3A2ACT7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Col9a3A2ACT7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Col9a3A2ACT7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Col9a3A2ACT7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Col9a3A2ACT7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Col9a3A2ACT7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Col9a3A2ACT7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Col9a3A2ACT7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Col9a3A2ACT7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Col9a3A2ACT7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Col9a3A2ACT7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Col9a3A2ACT7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Col9a3A2ACT7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Col9a3A2ACT7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Col9a3A2ACT7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Col9a3A2ACT7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Col9a3A2ACT7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Col9a3A2ACT7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Col9a3A2ACT7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Col9a3A2ACT7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Col9a3A2ACT7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Col9a3A2ACT7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Col9a3A2ACT7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Col9a3A2ACT7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Col9a3A2ACT7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Col9a3A2ACT7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Col9a3A2ACT7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Col9a3A2ACT7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col9a3A2ACT7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col9a3A2ACT7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col9a3A2ACT7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col9a3A2ACT7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col9a3A2ACT7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col9a3A2ACT7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col9a3A2ACT7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col9a3A2ACT7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col9a3A2ACT7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col9a3A2ACT7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col9a3A2ACT7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col9a3A2ACT7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Col9a3A2ACT7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col9a3A2ACT7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col9a3A2ACT7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col9a3A2ACT7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Col9a3A2ACT7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Col9a3A2ACT7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col9a3A2ACT7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col9a3A2ACT7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col9a3A2ACT7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col9a3A2ACT7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col9a3A2ACT7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col9a3A2ACT7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col9a3A2ACT7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col9a3A2ACT7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Col9a3A2ACT7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col9a3A2ACT7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col9a3A2ACT7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col9a3A2ACT7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col9a3A2ACT7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Col9a3A2ACT7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col9a3A2ACT7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col9a3A2ACT7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col9a3A2ACT7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col9a3A2ACT7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col9a3A2ACT7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col9a3A2ACT7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col9a3A2ACT7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col9a3A2ACT7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col9a3A2ACT7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col9a3A2ACT7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col9a3A2ACT7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Col9a3A2ACT7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col9a3A2ACT7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col9a3A2ACT7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col9a3A2ACT7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col9a3A2ACT7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col9a3A2ACT7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col9a3A2ACT7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col9a3A2ACT7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Col9a3A2ACT7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col9a3A2ACT7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col9a3A2ACT7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col9a3A2ACT7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col9a3A2ACT7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Col9a3A2ACT7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col9a3A2ACT7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col9a3A2ACT7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col9a3A2ACT7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Col9a3A2ACT7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Col9a3A2ACT7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Col9a3A2ACT7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Col9a3A2ACT7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Col9a3A2ACT7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Col9a3A2ACT7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Col9a3A2ACT7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Col9a3A2ACT7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Col9a3A2ACT7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Col9a3A2ACT7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Col9a3A2ACT7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms