Protein–RNA interactions for Protein: A2A6T1

Cdr2l, Cerebellar degeneration-related protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr2lA2A6T1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdr2lA2A6T1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdr2lA2A6T1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdr2lA2A6T1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdr2lA2A6T1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdr2lA2A6T1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdr2lA2A6T1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdr2lA2A6T1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdr2lA2A6T1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdr2lA2A6T1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdr2lA2A6T1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdr2lA2A6T1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdr2lA2A6T1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdr2lA2A6T1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdr2lA2A6T1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdr2lA2A6T1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdr2lA2A6T1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdr2lA2A6T1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdr2lA2A6T1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdr2lA2A6T1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdr2lA2A6T1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdr2lA2A6T1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdr2lA2A6T1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdr2lA2A6T1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdr2lA2A6T1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdr2lA2A6T1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdr2lA2A6T1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdr2lA2A6T1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdr2lA2A6T1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdr2lA2A6T1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdr2lA2A6T1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdr2lA2A6T1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdr2lA2A6T1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdr2lA2A6T1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdr2lA2A6T1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdr2lA2A6T1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdr2lA2A6T1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdr2lA2A6T1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdr2lA2A6T1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdr2lA2A6T1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdr2lA2A6T1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdr2lA2A6T1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdr2lA2A6T1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdr2lA2A6T1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdr2lA2A6T1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdr2lA2A6T1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdr2lA2A6T1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdr2lA2A6T1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdr2lA2A6T1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdr2lA2A6T1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdr2lA2A6T1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdr2lA2A6T1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdr2lA2A6T1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdr2lA2A6T1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdr2lA2A6T1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdr2lA2A6T1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdr2lA2A6T1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdr2lA2A6T1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdr2lA2A6T1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdr2lA2A6T1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdr2lA2A6T1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdr2lA2A6T1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdr2lA2A6T1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cdr2lA2A6T1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdr2lA2A6T1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdr2lA2A6T1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdr2lA2A6T1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdr2lA2A6T1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdr2lA2A6T1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdr2lA2A6T1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdr2lA2A6T1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdr2lA2A6T1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdr2lA2A6T1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdr2lA2A6T1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdr2lA2A6T1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdr2lA2A6T1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdr2lA2A6T1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdr2lA2A6T1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdr2lA2A6T1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdr2lA2A6T1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdr2lA2A6T1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdr2lA2A6T1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdr2lA2A6T1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdr2lA2A6T1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdr2lA2A6T1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdr2lA2A6T1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdr2lA2A6T1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdr2lA2A6T1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdr2lA2A6T1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdr2lA2A6T1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdr2lA2A6T1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cdr2lA2A6T1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cdr2lA2A6T1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdr2lA2A6T1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdr2lA2A6T1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdr2lA2A6T1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdr2lA2A6T1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdr2lA2A6T1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdr2lA2A6T1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdr2lA2A6T1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98 ms