Protein–RNA interactions for Protein: A2A4P4

Gm27029, Predicted gene, 27029, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm27029A2A4P4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm27029A2A4P4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm27029A2A4P4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm27029A2A4P4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm27029A2A4P4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm27029A2A4P4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm27029A2A4P4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm27029A2A4P4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm27029A2A4P4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm27029A2A4P4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm27029A2A4P4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm27029A2A4P4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm27029A2A4P4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm27029A2A4P4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm27029A2A4P4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm27029A2A4P4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm27029A2A4P4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm27029A2A4P4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm27029A2A4P4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm27029A2A4P4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm27029A2A4P4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm27029A2A4P4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm27029A2A4P4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm27029A2A4P4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm27029A2A4P4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm27029A2A4P4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm27029A2A4P4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm27029A2A4P4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm27029A2A4P4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm27029A2A4P4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm27029A2A4P4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm27029A2A4P4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm27029A2A4P4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm27029A2A4P4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm27029A2A4P4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm27029A2A4P4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm27029A2A4P4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm27029A2A4P4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm27029A2A4P4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm27029A2A4P4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm27029A2A4P4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm27029A2A4P4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm27029A2A4P4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm27029A2A4P4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm27029A2A4P4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm27029A2A4P4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm27029A2A4P4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm27029A2A4P4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm27029A2A4P4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm27029A2A4P4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm27029A2A4P4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm27029A2A4P4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm27029A2A4P4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm27029A2A4P4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm27029A2A4P4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm27029A2A4P4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm27029A2A4P4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm27029A2A4P4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm27029A2A4P4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm27029A2A4P4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm27029A2A4P4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm27029A2A4P4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm27029A2A4P4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm27029A2A4P4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm27029A2A4P4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm27029A2A4P4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm27029A2A4P4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm27029A2A4P4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm27029A2A4P4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm27029A2A4P4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm27029A2A4P4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm27029A2A4P4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm27029A2A4P4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm27029A2A4P4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm27029A2A4P4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm27029A2A4P4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm27029A2A4P4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm27029A2A4P4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm27029A2A4P4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm27029A2A4P4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm27029A2A4P4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm27029A2A4P4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm27029A2A4P4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm27029A2A4P4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm27029A2A4P4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm27029A2A4P4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm27029A2A4P4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm27029A2A4P4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm27029A2A4P4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm27029A2A4P4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm27029A2A4P4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm27029A2A4P4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm27029A2A4P4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm27029A2A4P4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm27029A2A4P4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm27029A2A4P4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm27029A2A4P4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm27029A2A4P4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm27029A2A4P4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm27029A2A4P4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms