Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H8

Igkv1-133, Immunoglobulin kappa variable 1-133 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Igkv1-133A0A0B4J1H8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Igkv1-133A0A0B4J1H8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Igkv1-133A0A0B4J1H8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Igkv1-133A0A0B4J1H8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Igkv1-133A0A0B4J1H8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Igkv1-133A0A0B4J1H8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Igkv1-133A0A0B4J1H8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms