Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt27Q9Z320 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt27Q9Z320 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt27Q9Z320 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt27Q9Z320 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt27Q9Z320 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt27Q9Z320 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt27Q9Z320 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt27Q9Z320 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt27Q9Z320 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt27Q9Z320 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt27Q9Z320 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt27Q9Z320 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt27Q9Z320 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt27Q9Z320 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt27Q9Z320 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt27Q9Z320 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt27Q9Z320 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt27Q9Z320 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt27Q9Z320 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt27Q9Z320 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Krt27Q9Z320 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt27Q9Z320 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt27Q9Z320 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt27Q9Z320 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt27Q9Z320 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt27Q9Z320 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt27Q9Z320 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt27Q9Z320 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Krt27Q9Z320 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Krt27Q9Z320 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Krt27Q9Z320 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Krt27Q9Z320 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Krt27Q9Z320 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt27Q9Z320 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt27Q9Z320 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt27Q9Z320 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt27Q9Z320 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt27Q9Z320 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt27Q9Z320 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt27Q9Z320 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt27Q9Z320 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt27Q9Z320 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt27Q9Z320 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt27Q9Z320 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt27Q9Z320 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt27Q9Z320 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt27Q9Z320 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt27Q9Z320 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt27Q9Z320 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt27Q9Z320 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt27Q9Z320 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt27Q9Z320 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt27Q9Z320 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt27Q9Z320 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt27Q9Z320 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt27Q9Z320 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt27Q9Z320 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt27Q9Z320 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt27Q9Z320 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt27Q9Z320 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt27Q9Z320 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt27Q9Z320 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt27Q9Z320 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt27Q9Z320 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt27Q9Z320 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt27Q9Z320 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt27Q9Z320 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt27Q9Z320 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt27Q9Z320 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Krt27Q9Z320 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Krt27Q9Z320 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt27Q9Z320 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt27Q9Z320 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt27Q9Z320 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt27Q9Z320 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt27Q9Z320 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt27Q9Z320 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt27Q9Z320 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt27Q9Z320 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt27Q9Z320 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt27Q9Z320 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt27Q9Z320 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt27Q9Z320 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt27Q9Z320 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt27Q9Z320 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt27Q9Z320 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt27Q9Z320 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt27Q9Z320 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt27Q9Z320 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt27Q9Z320 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt27Q9Z320 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt27Q9Z320 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt27Q9Z320 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt27Q9Z320 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt27Q9Z320 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt27Q9Z320 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt27Q9Z320 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt27Q9Z320 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt27Q9Z320 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms