Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Hdac5Q9Z2V6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Hdac5Q9Z2V6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Hdac5Q9Z2V6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Hdac5Q9Z2V6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Hdac5Q9Z2V6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Hdac5Q9Z2V6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Hdac5Q9Z2V6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Hdac5Q9Z2V6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Hdac5Q9Z2V6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Hdac5Q9Z2V6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Hdac5Q9Z2V6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Hdac5Q9Z2V6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Hdac5Q9Z2V6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Hdac5Q9Z2V6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Hdac5Q9Z2V6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Hdac5Q9Z2V6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Hdac5Q9Z2V6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Hdac5Q9Z2V6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Hdac5Q9Z2V6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Hdac5Q9Z2V6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Hdac5Q9Z2V6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Hdac5Q9Z2V6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Hdac5Q9Z2V6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Hdac5Q9Z2V6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Hdac5Q9Z2V6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Hdac5Q9Z2V6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Hdac5Q9Z2V6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Hdac5Q9Z2V6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Hdac5Q9Z2V6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Hdac5Q9Z2V6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Hdac5Q9Z2V6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Hdac5Q9Z2V6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Hdac5Q9Z2V6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Hdac5Q9Z2V6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Hdac5Q9Z2V6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Hdac5Q9Z2V6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Hdac5Q9Z2V6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Hdac5Q9Z2V6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Hdac5Q9Z2V6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Hdac5Q9Z2V6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Hdac5Q9Z2V6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Hdac5Q9Z2V6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Hdac5Q9Z2V6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Hdac5Q9Z2V6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Hdac5Q9Z2V6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Hdac5Q9Z2V6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Hdac5Q9Z2V6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Hdac5Q9Z2V6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Hdac5Q9Z2V6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Hdac5Q9Z2V6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Hdac5Q9Z2V6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Hdac5Q9Z2V6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Hdac5Q9Z2V6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Hdac5Q9Z2V6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Hdac5Q9Z2V6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Hdac5Q9Z2V6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Hdac5Q9Z2V6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Hdac5Q9Z2V6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Hdac5Q9Z2V6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Hdac5Q9Z2V6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Hdac5Q9Z2V6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Hdac5Q9Z2V6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Hdac5Q9Z2V6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Hdac5Q9Z2V6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Hdac5Q9Z2V6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Hdac5Q9Z2V6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Hdac5Q9Z2V6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Hdac5Q9Z2V6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Hdac5Q9Z2V6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Hdac5Q9Z2V6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Hdac5Q9Z2V6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Hdac5Q9Z2V6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Hdac5Q9Z2V6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Hdac5Q9Z2V6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Hdac5Q9Z2V6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Hdac5Q9Z2V6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Hdac5Q9Z2V6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Hdac5Q9Z2V6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Hdac5Q9Z2V6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Hdac5Q9Z2V6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Hdac5Q9Z2V6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Hdac5Q9Z2V6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Hdac5Q9Z2V6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Hdac5Q9Z2V6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Hdac5Q9Z2V6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Hdac5Q9Z2V6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Hdac5Q9Z2V6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Hdac5Q9Z2V6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Hdac5Q9Z2V6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Hdac5Q9Z2V6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Hdac5Q9Z2V6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Hdac5Q9Z2V6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Hdac5Q9Z2V6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Hdac5Q9Z2V6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Hdac5Q9Z2V6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Hdac5Q9Z2V6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Hdac5Q9Z2V6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Hdac5Q9Z2V6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Hdac5Q9Z2V6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms