Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Knop1Q9Z2Q2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Knop1Q9Z2Q2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Knop1Q9Z2Q2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Knop1Q9Z2Q2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Knop1Q9Z2Q2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Knop1Q9Z2Q2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Knop1Q9Z2Q2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Knop1Q9Z2Q2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Knop1Q9Z2Q2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Knop1Q9Z2Q2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Knop1Q9Z2Q2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Knop1Q9Z2Q2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Knop1Q9Z2Q2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Knop1Q9Z2Q2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Knop1Q9Z2Q2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Knop1Q9Z2Q2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Knop1Q9Z2Q2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Knop1Q9Z2Q2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Knop1Q9Z2Q2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Knop1Q9Z2Q2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Knop1Q9Z2Q2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Knop1Q9Z2Q2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Knop1Q9Z2Q2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Knop1Q9Z2Q2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Knop1Q9Z2Q2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Knop1Q9Z2Q2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Knop1Q9Z2Q2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Knop1Q9Z2Q2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Knop1Q9Z2Q2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Knop1Q9Z2Q2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Knop1Q9Z2Q2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Knop1Q9Z2Q2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Knop1Q9Z2Q2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Knop1Q9Z2Q2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Knop1Q9Z2Q2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Knop1Q9Z2Q2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Knop1Q9Z2Q2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Knop1Q9Z2Q2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Knop1Q9Z2Q2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Knop1Q9Z2Q2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Knop1Q9Z2Q2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Knop1Q9Z2Q2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Knop1Q9Z2Q2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Knop1Q9Z2Q2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Knop1Q9Z2Q2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Knop1Q9Z2Q2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Knop1Q9Z2Q2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Knop1Q9Z2Q2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Knop1Q9Z2Q2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Knop1Q9Z2Q2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Knop1Q9Z2Q2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Knop1Q9Z2Q2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Knop1Q9Z2Q2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Knop1Q9Z2Q2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Knop1Q9Z2Q2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Knop1Q9Z2Q2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Knop1Q9Z2Q2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Knop1Q9Z2Q2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Knop1Q9Z2Q2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Knop1Q9Z2Q2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Knop1Q9Z2Q2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Knop1Q9Z2Q2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Knop1Q9Z2Q2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Knop1Q9Z2Q2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Knop1Q9Z2Q2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Knop1Q9Z2Q2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Knop1Q9Z2Q2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Knop1Q9Z2Q2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Knop1Q9Z2Q2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Knop1Q9Z2Q2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Knop1Q9Z2Q2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Knop1Q9Z2Q2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Knop1Q9Z2Q2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Knop1Q9Z2Q2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Knop1Q9Z2Q2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Knop1Q9Z2Q2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Knop1Q9Z2Q2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Knop1Q9Z2Q2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Knop1Q9Z2Q2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Knop1Q9Z2Q2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Knop1Q9Z2Q2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Knop1Q9Z2Q2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Knop1Q9Z2Q2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Knop1Q9Z2Q2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Knop1Q9Z2Q2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Knop1Q9Z2Q2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Knop1Q9Z2Q2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Knop1Q9Z2Q2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Knop1Q9Z2Q2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Knop1Q9Z2Q2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Knop1Q9Z2Q2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Knop1Q9Z2Q2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Knop1Q9Z2Q2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Knop1Q9Z2Q2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Knop1Q9Z2Q2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Knop1Q9Z2Q2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Knop1Q9Z2Q2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Knop1Q9Z2Q2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Knop1Q9Z2Q2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms