Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubl3Q9Z2M6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubl3Q9Z2M6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubl3Q9Z2M6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubl3Q9Z2M6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubl3Q9Z2M6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubl3Q9Z2M6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubl3Q9Z2M6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubl3Q9Z2M6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubl3Q9Z2M6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubl3Q9Z2M6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubl3Q9Z2M6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubl3Q9Z2M6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubl3Q9Z2M6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubl3Q9Z2M6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubl3Q9Z2M6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubl3Q9Z2M6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubl3Q9Z2M6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubl3Q9Z2M6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubl3Q9Z2M6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubl3Q9Z2M6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubl3Q9Z2M6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ubl3Q9Z2M6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ubl3Q9Z2M6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ubl3Q9Z2M6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ubl3Q9Z2M6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ubl3Q9Z2M6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ubl3Q9Z2M6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ubl3Q9Z2M6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ubl3Q9Z2M6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ubl3Q9Z2M6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ubl3Q9Z2M6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ubl3Q9Z2M6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ubl3Q9Z2M6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubl3Q9Z2M6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubl3Q9Z2M6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubl3Q9Z2M6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubl3Q9Z2M6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubl3Q9Z2M6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubl3Q9Z2M6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubl3Q9Z2M6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubl3Q9Z2M6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubl3Q9Z2M6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubl3Q9Z2M6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubl3Q9Z2M6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubl3Q9Z2M6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubl3Q9Z2M6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ubl3Q9Z2M6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ubl3Q9Z2M6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ubl3Q9Z2M6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ubl3Q9Z2M6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ubl3Q9Z2M6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ubl3Q9Z2M6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ubl3Q9Z2M6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ubl3Q9Z2M6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ubl3Q9Z2M6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ubl3Q9Z2M6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubl3Q9Z2M6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubl3Q9Z2M6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubl3Q9Z2M6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubl3Q9Z2M6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubl3Q9Z2M6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubl3Q9Z2M6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubl3Q9Z2M6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubl3Q9Z2M6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubl3Q9Z2M6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubl3Q9Z2M6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubl3Q9Z2M6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubl3Q9Z2M6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubl3Q9Z2M6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubl3Q9Z2M6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubl3Q9Z2M6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubl3Q9Z2M6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubl3Q9Z2M6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubl3Q9Z2M6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubl3Q9Z2M6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubl3Q9Z2M6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubl3Q9Z2M6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubl3Q9Z2M6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubl3Q9Z2M6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubl3Q9Z2M6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubl3Q9Z2M6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubl3Q9Z2M6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubl3Q9Z2M6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubl3Q9Z2M6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubl3Q9Z2M6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubl3Q9Z2M6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubl3Q9Z2M6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubl3Q9Z2M6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubl3Q9Z2M6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubl3Q9Z2M6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubl3Q9Z2M6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubl3Q9Z2M6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubl3Q9Z2M6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubl3Q9Z2M6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubl3Q9Z2M6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubl3Q9Z2M6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubl3Q9Z2M6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubl3Q9Z2M6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubl3Q9Z2M6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms