Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUZ7

Sh3bgr, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrQ9WUZ7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sh3bgrQ9WUZ7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sh3bgrQ9WUZ7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sh3bgrQ9WUZ7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sh3bgrQ9WUZ7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sh3bgrQ9WUZ7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Sh3bgrQ9WUZ7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sh3bgrQ9WUZ7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sh3bgrQ9WUZ7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sh3bgrQ9WUZ7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sh3bgrQ9WUZ7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sh3bgrQ9WUZ7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Sh3bgrQ9WUZ7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sh3bgrQ9WUZ7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sh3bgrQ9WUZ7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sh3bgrQ9WUZ7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sh3bgrQ9WUZ7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sh3bgrQ9WUZ7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sh3bgrQ9WUZ7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sh3bgrQ9WUZ7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sh3bgrQ9WUZ7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sh3bgrQ9WUZ7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sh3bgrQ9WUZ7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sh3bgrQ9WUZ7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sh3bgrQ9WUZ7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sh3bgrQ9WUZ7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sh3bgrQ9WUZ7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sh3bgrQ9WUZ7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sh3bgrQ9WUZ7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sh3bgrQ9WUZ7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sh3bgrQ9WUZ7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sh3bgrQ9WUZ7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sh3bgrQ9WUZ7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sh3bgrQ9WUZ7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sh3bgrQ9WUZ7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sh3bgrQ9WUZ7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Sh3bgrQ9WUZ7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sh3bgrQ9WUZ7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sh3bgrQ9WUZ7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sh3bgrQ9WUZ7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sh3bgrQ9WUZ7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sh3bgrQ9WUZ7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sh3bgrQ9WUZ7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sh3bgrQ9WUZ7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sh3bgrQ9WUZ7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sh3bgrQ9WUZ7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sh3bgrQ9WUZ7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sh3bgrQ9WUZ7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sh3bgrQ9WUZ7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sh3bgrQ9WUZ7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sh3bgrQ9WUZ7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sh3bgrQ9WUZ7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sh3bgrQ9WUZ7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sh3bgrQ9WUZ7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sh3bgrQ9WUZ7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sh3bgrQ9WUZ7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sh3bgrQ9WUZ7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sh3bgrQ9WUZ7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sh3bgrQ9WUZ7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sh3bgrQ9WUZ7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sh3bgrQ9WUZ7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sh3bgrQ9WUZ7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sh3bgrQ9WUZ7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Sh3bgrQ9WUZ7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sh3bgrQ9WUZ7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sh3bgrQ9WUZ7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sh3bgrQ9WUZ7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sh3bgrQ9WUZ7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sh3bgrQ9WUZ7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sh3bgrQ9WUZ7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sh3bgrQ9WUZ7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sh3bgrQ9WUZ7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sh3bgrQ9WUZ7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sh3bgrQ9WUZ7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sh3bgrQ9WUZ7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Sh3bgrQ9WUZ7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sh3bgrQ9WUZ7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sh3bgrQ9WUZ7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sh3bgrQ9WUZ7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sh3bgrQ9WUZ7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sh3bgrQ9WUZ7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sh3bgrQ9WUZ7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sh3bgrQ9WUZ7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sh3bgrQ9WUZ7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sh3bgrQ9WUZ7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sh3bgrQ9WUZ7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sh3bgrQ9WUZ7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sh3bgrQ9WUZ7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sh3bgrQ9WUZ7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms