Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUK7

Opn3, Opsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn3Q9WUK7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Opn3Q9WUK7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Opn3Q9WUK7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Opn3Q9WUK7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Opn3Q9WUK7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Opn3Q9WUK7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Opn3Q9WUK7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Opn3Q9WUK7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Opn3Q9WUK7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Opn3Q9WUK7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Opn3Q9WUK7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Opn3Q9WUK7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Opn3Q9WUK7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Opn3Q9WUK7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Opn3Q9WUK7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Opn3Q9WUK7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Opn3Q9WUK7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Opn3Q9WUK7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Opn3Q9WUK7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Opn3Q9WUK7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Opn3Q9WUK7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Opn3Q9WUK7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Opn3Q9WUK7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Opn3Q9WUK7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Opn3Q9WUK7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Opn3Q9WUK7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Opn3Q9WUK7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Opn3Q9WUK7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Opn3Q9WUK7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Opn3Q9WUK7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Opn3Q9WUK7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Opn3Q9WUK7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Opn3Q9WUK7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Opn3Q9WUK7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Opn3Q9WUK7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Opn3Q9WUK7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Opn3Q9WUK7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Opn3Q9WUK7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Opn3Q9WUK7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Opn3Q9WUK7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Opn3Q9WUK7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Opn3Q9WUK7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Opn3Q9WUK7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Opn3Q9WUK7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Opn3Q9WUK7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Opn3Q9WUK7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Opn3Q9WUK7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Opn3Q9WUK7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Opn3Q9WUK7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Opn3Q9WUK7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Opn3Q9WUK7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Opn3Q9WUK7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Opn3Q9WUK7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Opn3Q9WUK7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Opn3Q9WUK7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Opn3Q9WUK7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Opn3Q9WUK7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Opn3Q9WUK7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Opn3Q9WUK7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Opn3Q9WUK7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Opn3Q9WUK7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Opn3Q9WUK7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Opn3Q9WUK7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Opn3Q9WUK7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Opn3Q9WUK7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Opn3Q9WUK7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Opn3Q9WUK7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Opn3Q9WUK7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Opn3Q9WUK7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Opn3Q9WUK7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Opn3Q9WUK7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Opn3Q9WUK7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Opn3Q9WUK7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Opn3Q9WUK7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Opn3Q9WUK7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Opn3Q9WUK7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Opn3Q9WUK7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Opn3Q9WUK7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Opn3Q9WUK7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Opn3Q9WUK7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Opn3Q9WUK7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Opn3Q9WUK7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Opn3Q9WUK7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Opn3Q9WUK7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Opn3Q9WUK7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Opn3Q9WUK7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Opn3Q9WUK7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Opn3Q9WUK7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Opn3Q9WUK7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Opn3Q9WUK7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Opn3Q9WUK7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Opn3Q9WUK7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Opn3Q9WUK7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Opn3Q9WUK7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Opn3Q9WUK7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Opn3Q9WUK7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Opn3Q9WUK7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Opn3Q9WUK7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Opn3Q9WUK7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Opn3Q9WUK7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms