Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G8

Nrk, Nik-related protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrkQ9R0G8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
NrkQ9R0G8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
NrkQ9R0G8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
NrkQ9R0G8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
NrkQ9R0G8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
NrkQ9R0G8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NrkQ9R0G8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NrkQ9R0G8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NrkQ9R0G8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NrkQ9R0G8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NrkQ9R0G8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NrkQ9R0G8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
NrkQ9R0G8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
NrkQ9R0G8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
NrkQ9R0G8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
NrkQ9R0G8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
NrkQ9R0G8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
NrkQ9R0G8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
NrkQ9R0G8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
NrkQ9R0G8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
NrkQ9R0G8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC34.07■■■■□ 3.05
NrkQ9R0G8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
NrkQ9R0G8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
NrkQ9R0G8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
NrkQ9R0G8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
NrkQ9R0G8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
NrkQ9R0G8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
NrkQ9R0G8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
NrkQ9R0G8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
NrkQ9R0G8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
NrkQ9R0G8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
NrkQ9R0G8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
NrkQ9R0G8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
NrkQ9R0G8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
NrkQ9R0G8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
NrkQ9R0G8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
NrkQ9R0G8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
NrkQ9R0G8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
NrkQ9R0G8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
NrkQ9R0G8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
NrkQ9R0G8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
NrkQ9R0G8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
NrkQ9R0G8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
NrkQ9R0G8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
NrkQ9R0G8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
NrkQ9R0G8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
NrkQ9R0G8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC34.02■■■■□ 3.04
NrkQ9R0G8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
NrkQ9R0G8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
NrkQ9R0G8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
NrkQ9R0G8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
NrkQ9R0G8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
NrkQ9R0G8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
NrkQ9R0G8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
NrkQ9R0G8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
NrkQ9R0G8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
NrkQ9R0G8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
NrkQ9R0G8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NrkQ9R0G8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
NrkQ9R0G8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NrkQ9R0G8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NrkQ9R0G8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NrkQ9R0G8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
NrkQ9R0G8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NrkQ9R0G8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
NrkQ9R0G8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NrkQ9R0G8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NrkQ9R0G8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NrkQ9R0G8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
NrkQ9R0G8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
NrkQ9R0G8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
NrkQ9R0G8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
NrkQ9R0G8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC33.97■■■■□ 3.03
NrkQ9R0G8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
NrkQ9R0G8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
NrkQ9R0G8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
NrkQ9R0G8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
NrkQ9R0G8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
NrkQ9R0G8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
NrkQ9R0G8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
NrkQ9R0G8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
NrkQ9R0G8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
NrkQ9R0G8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
NrkQ9R0G8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
NrkQ9R0G8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
NrkQ9R0G8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
NrkQ9R0G8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
NrkQ9R0G8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
NrkQ9R0G8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
NrkQ9R0G8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
NrkQ9R0G8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
NrkQ9R0G8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
NrkQ9R0G8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
NrkQ9R0G8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
NrkQ9R0G8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
NrkQ9R0G8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
NrkQ9R0G8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
NrkQ9R0G8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
NrkQ9R0G8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
NrkQ9R0G8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms