Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col4a4Q9QZR9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col4a4Q9QZR9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Col4a4Q9QZR9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col4a4Q9QZR9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col4a4Q9QZR9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Col4a4Q9QZR9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Col4a4Q9QZR9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Col4a4Q9QZR9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col4a4Q9QZR9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Col4a4Q9QZR9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col4a4Q9QZR9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col4a4Q9QZR9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col4a4Q9QZR9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col4a4Q9QZR9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Col4a4Q9QZR9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Col4a4Q9QZR9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Col4a4Q9QZR9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Col4a4Q9QZR9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Col4a4Q9QZR9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Col4a4Q9QZR9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Col4a4Q9QZR9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Col4a4Q9QZR9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Col4a4Q9QZR9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Col4a4Q9QZR9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Col4a4Q9QZR9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Col4a4Q9QZR9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Col4a4Q9QZR9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Col4a4Q9QZR9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Col4a4Q9QZR9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Col4a4Q9QZR9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Col4a4Q9QZR9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Col4a4Q9QZR9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Col4a4Q9QZR9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Col4a4Q9QZR9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Col4a4Q9QZR9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Col4a4Q9QZR9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Col4a4Q9QZR9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Col4a4Q9QZR9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Col4a4Q9QZR9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Col4a4Q9QZR9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Col4a4Q9QZR9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Col4a4Q9QZR9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Col4a4Q9QZR9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Col4a4Q9QZR9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col4a4Q9QZR9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col4a4Q9QZR9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col4a4Q9QZR9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col4a4Q9QZR9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col4a4Q9QZR9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col4a4Q9QZR9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Col4a4Q9QZR9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Col4a4Q9QZR9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Col4a4Q9QZR9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Col4a4Q9QZR9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Col4a4Q9QZR9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Col4a4Q9QZR9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col4a4Q9QZR9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col4a4Q9QZR9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col4a4Q9QZR9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col4a4Q9QZR9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col4a4Q9QZR9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Col4a4Q9QZR9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col4a4Q9QZR9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col4a4Q9QZR9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col4a4Q9QZR9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col4a4Q9QZR9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col4a4Q9QZR9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col4a4Q9QZR9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col4a4Q9QZR9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col4a4Q9QZR9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col4a4Q9QZR9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col4a4Q9QZR9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Col4a4Q9QZR9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Col4a4Q9QZR9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Col4a4Q9QZR9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Col4a4Q9QZR9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Col4a4Q9QZR9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Col4a4Q9QZR9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Col4a4Q9QZR9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Col4a4Q9QZR9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Col4a4Q9QZR9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Col4a4Q9QZR9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Col4a4Q9QZR9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Col4a4Q9QZR9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Col4a4Q9QZR9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Col4a4Q9QZR9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Col4a4Q9QZR9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Col4a4Q9QZR9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Col4a4Q9QZR9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Col4a4Q9QZR9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Col4a4Q9QZR9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Col4a4Q9QZR9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Col4a4Q9QZR9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Col4a4Q9QZR9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Col4a4Q9QZR9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Col4a4Q9QZR9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Col4a4Q9QZR9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Col4a4Q9QZR9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Col4a4Q9QZR9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms