Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gpc1Q9QZF2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gpc1Q9QZF2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gpc1Q9QZF2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gpc1Q9QZF2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gpc1Q9QZF2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gpc1Q9QZF2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Gpc1Q9QZF2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gpc1Q9QZF2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gpc1Q9QZF2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gpc1Q9QZF2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gpc1Q9QZF2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gpc1Q9QZF2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Gpc1Q9QZF2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gpc1Q9QZF2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gpc1Q9QZF2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gpc1Q9QZF2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gpc1Q9QZF2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gpc1Q9QZF2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Gpc1Q9QZF2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gpc1Q9QZF2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gpc1Q9QZF2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gpc1Q9QZF2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Gpc1Q9QZF2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gpc1Q9QZF2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gpc1Q9QZF2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gpc1Q9QZF2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gpc1Q9QZF2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gpc1Q9QZF2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gpc1Q9QZF2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gpc1Q9QZF2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gpc1Q9QZF2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Gpc1Q9QZF2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gpc1Q9QZF2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gpc1Q9QZF2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gpc1Q9QZF2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gpc1Q9QZF2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gpc1Q9QZF2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gpc1Q9QZF2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gpc1Q9QZF2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gpc1Q9QZF2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gpc1Q9QZF2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Gpc1Q9QZF2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Gpc1Q9QZF2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gpc1Q9QZF2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gpc1Q9QZF2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gpc1Q9QZF2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gpc1Q9QZF2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gpc1Q9QZF2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gpc1Q9QZF2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gpc1Q9QZF2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gpc1Q9QZF2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Gpc1Q9QZF2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gpc1Q9QZF2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Gpc1Q9QZF2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gpc1Q9QZF2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gpc1Q9QZF2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gpc1Q9QZF2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gpc1Q9QZF2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gpc1Q9QZF2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gpc1Q9QZF2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Gpc1Q9QZF2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gpc1Q9QZF2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gpc1Q9QZF2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gpc1Q9QZF2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gpc1Q9QZF2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gpc1Q9QZF2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gpc1Q9QZF2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gpc1Q9QZF2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gpc1Q9QZF2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gpc1Q9QZF2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gpc1Q9QZF2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gpc1Q9QZF2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gpc1Q9QZF2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gpc1Q9QZF2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gpc1Q9QZF2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gpc1Q9QZF2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gpc1Q9QZF2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gpc1Q9QZF2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gpc1Q9QZF2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gpc1Q9QZF2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Gpc1Q9QZF2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gpc1Q9QZF2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gpc1Q9QZF2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gpc1Q9QZF2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gpc1Q9QZF2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gpc1Q9QZF2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gpc1Q9QZF2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gpc1Q9QZF2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gpc1Q9QZF2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gpc1Q9QZF2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Gpc1Q9QZF2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gpc1Q9QZF2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gpc1Q9QZF2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gpc1Q9QZF2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gpc1Q9QZF2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gpc1Q9QZF2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gpc1Q9QZF2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gpc1Q9QZF2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gpc1Q9QZF2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms