Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYY8

Spast, Spastin, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpastQ9QYY8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SpastQ9QYY8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SpastQ9QYY8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SpastQ9QYY8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SpastQ9QYY8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SpastQ9QYY8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SpastQ9QYY8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SpastQ9QYY8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SpastQ9QYY8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SpastQ9QYY8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SpastQ9QYY8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SpastQ9QYY8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SpastQ9QYY8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SpastQ9QYY8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SpastQ9QYY8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SpastQ9QYY8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SpastQ9QYY8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SpastQ9QYY8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SpastQ9QYY8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SpastQ9QYY8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SpastQ9QYY8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SpastQ9QYY8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SpastQ9QYY8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SpastQ9QYY8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SpastQ9QYY8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SpastQ9QYY8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SpastQ9QYY8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SpastQ9QYY8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SpastQ9QYY8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SpastQ9QYY8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SpastQ9QYY8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SpastQ9QYY8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SpastQ9QYY8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SpastQ9QYY8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SpastQ9QYY8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SpastQ9QYY8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SpastQ9QYY8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SpastQ9QYY8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SpastQ9QYY8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SpastQ9QYY8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SpastQ9QYY8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SpastQ9QYY8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SpastQ9QYY8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SpastQ9QYY8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SpastQ9QYY8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SpastQ9QYY8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SpastQ9QYY8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SpastQ9QYY8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SpastQ9QYY8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SpastQ9QYY8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SpastQ9QYY8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SpastQ9QYY8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SpastQ9QYY8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SpastQ9QYY8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SpastQ9QYY8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SpastQ9QYY8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SpastQ9QYY8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SpastQ9QYY8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SpastQ9QYY8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SpastQ9QYY8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SpastQ9QYY8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SpastQ9QYY8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SpastQ9QYY8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SpastQ9QYY8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SpastQ9QYY8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SpastQ9QYY8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SpastQ9QYY8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SpastQ9QYY8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SpastQ9QYY8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SpastQ9QYY8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SpastQ9QYY8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SpastQ9QYY8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SpastQ9QYY8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SpastQ9QYY8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SpastQ9QYY8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SpastQ9QYY8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SpastQ9QYY8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SpastQ9QYY8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SpastQ9QYY8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SpastQ9QYY8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SpastQ9QYY8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SpastQ9QYY8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SpastQ9QYY8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SpastQ9QYY8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SpastQ9QYY8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SpastQ9QYY8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SpastQ9QYY8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SpastQ9QYY8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SpastQ9QYY8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SpastQ9QYY8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SpastQ9QYY8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SpastQ9QYY8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SpastQ9QYY8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SpastQ9QYY8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SpastQ9QYY8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SpastQ9QYY8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SpastQ9QYY8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SpastQ9QYY8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SpastQ9QYY8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SpastQ9QYY8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 194.3 ms