Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA5

Lsm4, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm4Q9QXA5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lsm4Q9QXA5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lsm4Q9QXA5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lsm4Q9QXA5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lsm4Q9QXA5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lsm4Q9QXA5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lsm4Q9QXA5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lsm4Q9QXA5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lsm4Q9QXA5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lsm4Q9QXA5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lsm4Q9QXA5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lsm4Q9QXA5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lsm4Q9QXA5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lsm4Q9QXA5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lsm4Q9QXA5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lsm4Q9QXA5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lsm4Q9QXA5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lsm4Q9QXA5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lsm4Q9QXA5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lsm4Q9QXA5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lsm4Q9QXA5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lsm4Q9QXA5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lsm4Q9QXA5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lsm4Q9QXA5 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lsm4Q9QXA5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lsm4Q9QXA5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lsm4Q9QXA5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lsm4Q9QXA5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lsm4Q9QXA5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lsm4Q9QXA5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lsm4Q9QXA5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Lsm4Q9QXA5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lsm4Q9QXA5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lsm4Q9QXA5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lsm4Q9QXA5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lsm4Q9QXA5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lsm4Q9QXA5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lsm4Q9QXA5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lsm4Q9QXA5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lsm4Q9QXA5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lsm4Q9QXA5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lsm4Q9QXA5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lsm4Q9QXA5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lsm4Q9QXA5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lsm4Q9QXA5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lsm4Q9QXA5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lsm4Q9QXA5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lsm4Q9QXA5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lsm4Q9QXA5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lsm4Q9QXA5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lsm4Q9QXA5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lsm4Q9QXA5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lsm4Q9QXA5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lsm4Q9QXA5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lsm4Q9QXA5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lsm4Q9QXA5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lsm4Q9QXA5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lsm4Q9QXA5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lsm4Q9QXA5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lsm4Q9QXA5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lsm4Q9QXA5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lsm4Q9QXA5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lsm4Q9QXA5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lsm4Q9QXA5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lsm4Q9QXA5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lsm4Q9QXA5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lsm4Q9QXA5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lsm4Q9QXA5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lsm4Q9QXA5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lsm4Q9QXA5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lsm4Q9QXA5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lsm4Q9QXA5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lsm4Q9QXA5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lsm4Q9QXA5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lsm4Q9QXA5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lsm4Q9QXA5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lsm4Q9QXA5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lsm4Q9QXA5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lsm4Q9QXA5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lsm4Q9QXA5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lsm4Q9QXA5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lsm4Q9QXA5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lsm4Q9QXA5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lsm4Q9QXA5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lsm4Q9QXA5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lsm4Q9QXA5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lsm4Q9QXA5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lsm4Q9QXA5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lsm4Q9QXA5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lsm4Q9QXA5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lsm4Q9QXA5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lsm4Q9QXA5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lsm4Q9QXA5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lsm4Q9QXA5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lsm4Q9QXA5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lsm4Q9QXA5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Lsm4Q9QXA5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lsm4Q9QXA5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lsm4Q9QXA5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lsm4Q9QXA5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.2 ms