Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Dkk3Q9QUN9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Dkk3Q9QUN9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Dkk3Q9QUN9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Dkk3Q9QUN9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Dkk3Q9QUN9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Dkk3Q9QUN9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Dkk3Q9QUN9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Dkk3Q9QUN9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Dkk3Q9QUN9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Dkk3Q9QUN9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Dkk3Q9QUN9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Dkk3Q9QUN9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Dkk3Q9QUN9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Dkk3Q9QUN9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Dkk3Q9QUN9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Dkk3Q9QUN9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Dkk3Q9QUN9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Dkk3Q9QUN9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Dkk3Q9QUN9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Dkk3Q9QUN9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Dkk3Q9QUN9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Dkk3Q9QUN9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Dkk3Q9QUN9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Dkk3Q9QUN9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Dkk3Q9QUN9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Dkk3Q9QUN9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Dkk3Q9QUN9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Dkk3Q9QUN9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Dkk3Q9QUN9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Dkk3Q9QUN9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Dkk3Q9QUN9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Dkk3Q9QUN9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Dkk3Q9QUN9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Dkk3Q9QUN9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Dkk3Q9QUN9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Dkk3Q9QUN9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Dkk3Q9QUN9 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Dkk3Q9QUN9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Dkk3Q9QUN9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Dkk3Q9QUN9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Dkk3Q9QUN9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Dkk3Q9QUN9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Dkk3Q9QUN9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Dkk3Q9QUN9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Dkk3Q9QUN9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Dkk3Q9QUN9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Dkk3Q9QUN9 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Dkk3Q9QUN9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Dkk3Q9QUN9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Dkk3Q9QUN9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Dkk3Q9QUN9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Dkk3Q9QUN9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Dkk3Q9QUN9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Dkk3Q9QUN9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Dkk3Q9QUN9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Dkk3Q9QUN9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Dkk3Q9QUN9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Dkk3Q9QUN9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Dkk3Q9QUN9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Dkk3Q9QUN9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Dkk3Q9QUN9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Dkk3Q9QUN9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Dkk3Q9QUN9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Dkk3Q9QUN9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Dkk3Q9QUN9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Dkk3Q9QUN9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Dkk3Q9QUN9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Dkk3Q9QUN9 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Dkk3Q9QUN9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Dkk3Q9QUN9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Dkk3Q9QUN9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Dkk3Q9QUN9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Dkk3Q9QUN9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Dkk3Q9QUN9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Dkk3Q9QUN9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Dkk3Q9QUN9 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Dkk3Q9QUN9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Dkk3Q9QUN9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Dkk3Q9QUN9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Dkk3Q9QUN9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Dkk3Q9QUN9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Dkk3Q9QUN9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Dkk3Q9QUN9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Dkk3Q9QUN9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Dkk3Q9QUN9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Dkk3Q9QUN9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Dkk3Q9QUN9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Dkk3Q9QUN9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Dkk3Q9QUN9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Dkk3Q9QUN9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Dkk3Q9QUN9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Dkk3Q9QUN9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Dkk3Q9QUN9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Dkk3Q9QUN9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Dkk3Q9QUN9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Dkk3Q9QUN9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Dkk3Q9QUN9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Dkk3Q9QUN9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Dkk3Q9QUN9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms